Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1C6

Lrig3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig3Q6P1C6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Lrig3Q6P1C6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Lrig3Q6P1C6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Lrig3Q6P1C6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Lrig3Q6P1C6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Lrig3Q6P1C6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Lrig3Q6P1C6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lrig3Q6P1C6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Lrig3Q6P1C6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Lrig3Q6P1C6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Lrig3Q6P1C6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Lrig3Q6P1C6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Lrig3Q6P1C6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Lrig3Q6P1C6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Lrig3Q6P1C6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Lrig3Q6P1C6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Lrig3Q6P1C6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Lrig3Q6P1C6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Lrig3Q6P1C6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Lrig3Q6P1C6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Lrig3Q6P1C6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Lrig3Q6P1C6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Lrig3Q6P1C6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Lrig3Q6P1C6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Lrig3Q6P1C6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Lrig3Q6P1C6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Lrig3Q6P1C6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Lrig3Q6P1C6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Lrig3Q6P1C6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
Lrig3Q6P1C6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Lrig3Q6P1C6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Lrig3Q6P1C6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Lrig3Q6P1C6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Lrig3Q6P1C6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Lrig3Q6P1C6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Lrig3Q6P1C6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Lrig3Q6P1C6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Lrig3Q6P1C6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Lrig3Q6P1C6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Lrig3Q6P1C6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Lrig3Q6P1C6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Lrig3Q6P1C6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Lrig3Q6P1C6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Lrig3Q6P1C6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Lrig3Q6P1C6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Lrig3Q6P1C6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lrig3Q6P1C6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lrig3Q6P1C6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lrig3Q6P1C6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lrig3Q6P1C6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lrig3Q6P1C6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lrig3Q6P1C6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Lrig3Q6P1C6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lrig3Q6P1C6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lrig3Q6P1C6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lrig3Q6P1C6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lrig3Q6P1C6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lrig3Q6P1C6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Lrig3Q6P1C6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Lrig3Q6P1C6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Lrig3Q6P1C6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Lrig3Q6P1C6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Lrig3Q6P1C6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lrig3Q6P1C6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Lrig3Q6P1C6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Lrig3Q6P1C6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lrig3Q6P1C6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lrig3Q6P1C6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lrig3Q6P1C6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Lrig3Q6P1C6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Lrig3Q6P1C6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Lrig3Q6P1C6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Lrig3Q6P1C6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Lrig3Q6P1C6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Lrig3Q6P1C6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Lrig3Q6P1C6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Lrig3Q6P1C6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Lrig3Q6P1C6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Lrig3Q6P1C6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Lrig3Q6P1C6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Lrig3Q6P1C6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Lrig3Q6P1C6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Lrig3Q6P1C6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lrig3Q6P1C6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Lrig3Q6P1C6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Lrig3Q6P1C6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Lrig3Q6P1C6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Lrig3Q6P1C6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Lrig3Q6P1C6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Lrig3Q6P1C6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Lrig3Q6P1C6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Lrig3Q6P1C6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Lrig3Q6P1C6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Lrig3Q6P1C6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Lrig3Q6P1C6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Lrig3Q6P1C6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Lrig3Q6P1C6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Lrig3Q6P1C6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Lrig3Q6P1C6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Lrig3Q6P1C6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms