Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVE3

Spin2c, Spindlin-2C, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spin2cQ6NVE3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spin2cQ6NVE3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spin2cQ6NVE3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spin2cQ6NVE3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spin2cQ6NVE3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spin2cQ6NVE3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spin2cQ6NVE3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Spin2cQ6NVE3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Spin2cQ6NVE3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Spin2cQ6NVE3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spin2cQ6NVE3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spin2cQ6NVE3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spin2cQ6NVE3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spin2cQ6NVE3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Spin2cQ6NVE3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spin2cQ6NVE3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spin2cQ6NVE3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spin2cQ6NVE3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Spin2cQ6NVE3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Spin2cQ6NVE3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Spin2cQ6NVE3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Spin2cQ6NVE3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spin2cQ6NVE3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Spin2cQ6NVE3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Spin2cQ6NVE3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spin2cQ6NVE3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Spin2cQ6NVE3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Spin2cQ6NVE3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Spin2cQ6NVE3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Spin2cQ6NVE3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Spin2cQ6NVE3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Spin2cQ6NVE3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Spin2cQ6NVE3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Spin2cQ6NVE3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Spin2cQ6NVE3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Spin2cQ6NVE3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Spin2cQ6NVE3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Spin2cQ6NVE3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Spin2cQ6NVE3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Spin2cQ6NVE3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Spin2cQ6NVE3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Spin2cQ6NVE3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Spin2cQ6NVE3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Spin2cQ6NVE3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Spin2cQ6NVE3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Spin2cQ6NVE3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Spin2cQ6NVE3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Spin2cQ6NVE3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Spin2cQ6NVE3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Spin2cQ6NVE3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Spin2cQ6NVE3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Spin2cQ6NVE3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Spin2cQ6NVE3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Spin2cQ6NVE3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Spin2cQ6NVE3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Spin2cQ6NVE3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Spin2cQ6NVE3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Spin2cQ6NVE3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Spin2cQ6NVE3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Spin2cQ6NVE3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Spin2cQ6NVE3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Spin2cQ6NVE3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Spin2cQ6NVE3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Spin2cQ6NVE3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Spin2cQ6NVE3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Spin2cQ6NVE3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Spin2cQ6NVE3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Spin2cQ6NVE3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Spin2cQ6NVE3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Spin2cQ6NVE3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Spin2cQ6NVE3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Spin2cQ6NVE3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Spin2cQ6NVE3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Spin2cQ6NVE3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Spin2cQ6NVE3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Spin2cQ6NVE3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Spin2cQ6NVE3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Spin2cQ6NVE3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Spin2cQ6NVE3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Spin2cQ6NVE3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Spin2cQ6NVE3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Spin2cQ6NVE3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Spin2cQ6NVE3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Spin2cQ6NVE3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Spin2cQ6NVE3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Spin2cQ6NVE3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Spin2cQ6NVE3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Spin2cQ6NVE3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Spin2cQ6NVE3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Spin2cQ6NVE3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Spin2cQ6NVE3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Spin2cQ6NVE3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Spin2cQ6NVE3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Spin2cQ6NVE3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Spin2cQ6NVE3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Spin2cQ6NVE3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Spin2cQ6NVE3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Spin2cQ6NVE3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Spin2cQ6NVE3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Spin2cQ6NVE3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91 ms