Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQU0

UPF0524 protein C3orf70 homolog, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6GQU0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Q6GQU0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Q6GQU0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Q6GQU0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Q6GQU0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Q6GQU0 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Q6GQU0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Q6GQU0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Q6GQU0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Q6GQU0 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Q6GQU0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Q6GQU0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Q6GQU0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Q6GQU0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Q6GQU0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Q6GQU0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Q6GQU0 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Q6GQU0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Q6GQU0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Q6GQU0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Q6GQU0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Q6GQU0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Q6GQU0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Q6GQU0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Q6GQU0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Q6GQU0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Q6GQU0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Q6GQU0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Q6GQU0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Q6GQU0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Q6GQU0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Q6GQU0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Q6GQU0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Q6GQU0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Q6GQU0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Q6GQU0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Q6GQU0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Q6GQU0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Q6GQU0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Q6GQU0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Q6GQU0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Q6GQU0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Q6GQU0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Q6GQU0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Q6GQU0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Q6GQU0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Q6GQU0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Q6GQU0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Q6GQU0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Q6GQU0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Q6GQU0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Q6GQU0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Q6GQU0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Q6GQU0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Q6GQU0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Q6GQU0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Q6GQU0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Q6GQU0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Q6GQU0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Q6GQU0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Q6GQU0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Q6GQU0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Q6GQU0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Q6GQU0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Q6GQU0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Q6GQU0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Q6GQU0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Q6GQU0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Q6GQU0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Q6GQU0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Q6GQU0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Q6GQU0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Q6GQU0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Q6GQU0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Q6GQU0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Q6GQU0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Q6GQU0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Q6GQU0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Q6GQU0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Q6GQU0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Q6GQU0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Q6GQU0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Q6GQU0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Q6GQU0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Q6GQU0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Q6GQU0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Q6GQU0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Q6GQU0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Q6GQU0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Q6GQU0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Q6GQU0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Q6GQU0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Q6GQU0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Q6GQU0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Q6GQU0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Q6GQU0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Q6GQU0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Q6GQU0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Q6GQU0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Q6GQU0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
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