Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ctnna3Q65CL1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ctnna3Q65CL1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ctnna3Q65CL1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ctnna3Q65CL1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Ctnna3Q65CL1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ctnna3Q65CL1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Ctnna3Q65CL1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Ctnna3Q65CL1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ctnna3Q65CL1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ctnna3Q65CL1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Ctnna3Q65CL1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ctnna3Q65CL1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ctnna3Q65CL1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ctnna3Q65CL1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ctnna3Q65CL1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ctnna3Q65CL1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ctnna3Q65CL1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ctnna3Q65CL1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ctnna3Q65CL1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ctnna3Q65CL1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ctnna3Q65CL1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Ctnna3Q65CL1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ctnna3Q65CL1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ctnna3Q65CL1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ctnna3Q65CL1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ctnna3Q65CL1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ctnna3Q65CL1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ctnna3Q65CL1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ctnna3Q65CL1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Ctnna3Q65CL1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ctnna3Q65CL1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ctnna3Q65CL1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ctnna3Q65CL1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ctnna3Q65CL1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ctnna3Q65CL1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Ctnna3Q65CL1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ctnna3Q65CL1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ctnna3Q65CL1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ctnna3Q65CL1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ctnna3Q65CL1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ctnna3Q65CL1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ctnna3Q65CL1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ctnna3Q65CL1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ctnna3Q65CL1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ctnna3Q65CL1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ctnna3Q65CL1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ctnna3Q65CL1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ctnna3Q65CL1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ctnna3Q65CL1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ctnna3Q65CL1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ctnna3Q65CL1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ctnna3Q65CL1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ctnna3Q65CL1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ctnna3Q65CL1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ctnna3Q65CL1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ctnna3Q65CL1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ctnna3Q65CL1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Ctnna3Q65CL1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ctnna3Q65CL1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ctnna3Q65CL1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Ctnna3Q65CL1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ctnna3Q65CL1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ctnna3Q65CL1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ctnna3Q65CL1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ctnna3Q65CL1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ctnna3Q65CL1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Ctnna3Q65CL1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ctnna3Q65CL1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ctnna3Q65CL1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ctnna3Q65CL1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ctnna3Q65CL1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ctnna3Q65CL1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ctnna3Q65CL1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ctnna3Q65CL1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ctnna3Q65CL1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ctnna3Q65CL1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ctnna3Q65CL1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Ctnna3Q65CL1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ctnna3Q65CL1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ctnna3Q65CL1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Ctnna3Q65CL1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ctnna3Q65CL1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ctnna3Q65CL1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ctnna3Q65CL1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ctnna3Q65CL1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ctnna3Q65CL1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ctnna3Q65CL1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ctnna3Q65CL1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ctnna3Q65CL1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ctnna3Q65CL1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ctnna3Q65CL1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ctnna3Q65CL1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Ctnna3Q65CL1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Ctnna3Q65CL1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ctnna3Q65CL1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ctnna3Q65CL1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ctnna3Q65CL1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ctnna3Q65CL1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ctnna3Q65CL1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms