Protein–RNA interactions for Protein: Q64691

Capn3, Calpain-3, mousemouse

Predictions only

Length 821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn3Q64691 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Capn3Q64691 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Capn3Q64691 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Capn3Q64691 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Capn3Q64691 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Capn3Q64691 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Capn3Q64691 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Capn3Q64691 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Capn3Q64691 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Capn3Q64691 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Capn3Q64691 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Capn3Q64691 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Capn3Q64691 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Capn3Q64691 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Capn3Q64691 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Capn3Q64691 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Capn3Q64691 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Capn3Q64691 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Capn3Q64691 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Capn3Q64691 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Capn3Q64691 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Capn3Q64691 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Capn3Q64691 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Capn3Q64691 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Capn3Q64691 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Capn3Q64691 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Capn3Q64691 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Capn3Q64691 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Capn3Q64691 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Capn3Q64691 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Capn3Q64691 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Capn3Q64691 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Capn3Q64691 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Capn3Q64691 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Capn3Q64691 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Capn3Q64691 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Capn3Q64691 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Capn3Q64691 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Capn3Q64691 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Capn3Q64691 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Capn3Q64691 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Capn3Q64691 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Capn3Q64691 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Capn3Q64691 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Capn3Q64691 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Capn3Q64691 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Capn3Q64691 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Capn3Q64691 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Capn3Q64691 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Capn3Q64691 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Capn3Q64691 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Capn3Q64691 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Capn3Q64691 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Capn3Q64691 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Capn3Q64691 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Capn3Q64691 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Capn3Q64691 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Capn3Q64691 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Capn3Q64691 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Capn3Q64691 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Capn3Q64691 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Capn3Q64691 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Capn3Q64691 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Capn3Q64691 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Capn3Q64691 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Capn3Q64691 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Capn3Q64691 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Capn3Q64691 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Capn3Q64691 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Capn3Q64691 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Capn3Q64691 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Capn3Q64691 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Capn3Q64691 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Capn3Q64691 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Capn3Q64691 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Capn3Q64691 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Capn3Q64691 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Capn3Q64691 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Capn3Q64691 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Capn3Q64691 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Capn3Q64691 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Capn3Q64691 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Capn3Q64691 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Capn3Q64691 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Capn3Q64691 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Capn3Q64691 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Capn3Q64691 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Capn3Q64691 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Capn3Q64691 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Capn3Q64691 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Capn3Q64691 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Capn3Q64691 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Capn3Q64691 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Capn3Q64691 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Capn3Q64691 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Capn3Q64691 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Capn3Q64691 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Capn3Q64691 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Capn3Q64691 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Capn3Q64691 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms