Protein–RNA interactions for Protein: Q64444

Ca4, Carbonic anhydrase 4, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ca4Q64444 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Ca4Q64444 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Ca4Q64444 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ca4Q64444 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ca4Q64444 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Ca4Q64444 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ca4Q64444 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ca4Q64444 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ca4Q64444 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ca4Q64444 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ca4Q64444 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ca4Q64444 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ca4Q64444 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ca4Q64444 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ca4Q64444 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ca4Q64444 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ca4Q64444 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ca4Q64444 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ca4Q64444 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ca4Q64444 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ca4Q64444 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ca4Q64444 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ca4Q64444 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ca4Q64444 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ca4Q64444 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ca4Q64444 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ca4Q64444 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ca4Q64444 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ca4Q64444 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ca4Q64444 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ca4Q64444 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ca4Q64444 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ca4Q64444 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ca4Q64444 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ca4Q64444 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ca4Q64444 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ca4Q64444 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ca4Q64444 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ca4Q64444 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ca4Q64444 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ca4Q64444 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ca4Q64444 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ca4Q64444 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ca4Q64444 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ca4Q64444 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ca4Q64444 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ca4Q64444 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ca4Q64444 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ca4Q64444 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Ca4Q64444 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ca4Q64444 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ca4Q64444 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ca4Q64444 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ca4Q64444 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ca4Q64444 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ca4Q64444 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ca4Q64444 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ca4Q64444 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ca4Q64444 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ca4Q64444 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ca4Q64444 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Ca4Q64444 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ca4Q64444 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ca4Q64444 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ca4Q64444 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Ca4Q64444 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ca4Q64444 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ca4Q64444 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ca4Q64444 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ca4Q64444 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ca4Q64444 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ca4Q64444 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ca4Q64444 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ca4Q64444 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ca4Q64444 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ca4Q64444 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ca4Q64444 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ca4Q64444 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Ca4Q64444 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ca4Q64444 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ca4Q64444 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ca4Q64444 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ca4Q64444 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ca4Q64444 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ca4Q64444 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ca4Q64444 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ca4Q64444 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ca4Q64444 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ca4Q64444 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ca4Q64444 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ca4Q64444 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ca4Q64444 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ca4Q64444 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ca4Q64444 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ca4Q64444 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ca4Q64444 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ca4Q64444 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ca4Q64444 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ca4Q64444 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ca4Q64444 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms