Protein–RNA interactions for Protein: Q62217

Sema5a, Semaphorin-5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5aQ62217 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sema5aQ62217 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sema5aQ62217 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sema5aQ62217 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sema5aQ62217 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sema5aQ62217 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sema5aQ62217 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Sema5aQ62217 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Sema5aQ62217 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sema5aQ62217 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Sema5aQ62217 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Sema5aQ62217 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Sema5aQ62217 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sema5aQ62217 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sema5aQ62217 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sema5aQ62217 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sema5aQ62217 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sema5aQ62217 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sema5aQ62217 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Sema5aQ62217 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Sema5aQ62217 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Sema5aQ62217 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sema5aQ62217 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sema5aQ62217 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sema5aQ62217 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sema5aQ62217 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sema5aQ62217 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sema5aQ62217 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Sema5aQ62217 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Sema5aQ62217 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sema5aQ62217 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sema5aQ62217 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Sema5aQ62217 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sema5aQ62217 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sema5aQ62217 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Sema5aQ62217 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sema5aQ62217 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sema5aQ62217 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sema5aQ62217 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sema5aQ62217 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sema5aQ62217 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sema5aQ62217 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sema5aQ62217 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Sema5aQ62217 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sema5aQ62217 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sema5aQ62217 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sema5aQ62217 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sema5aQ62217 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sema5aQ62217 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sema5aQ62217 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sema5aQ62217 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sema5aQ62217 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sema5aQ62217 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sema5aQ62217 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sema5aQ62217 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sema5aQ62217 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sema5aQ62217 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sema5aQ62217 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sema5aQ62217 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sema5aQ62217 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sema5aQ62217 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sema5aQ62217 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sema5aQ62217 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sema5aQ62217 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sema5aQ62217 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sema5aQ62217 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sema5aQ62217 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sema5aQ62217 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sema5aQ62217 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sema5aQ62217 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sema5aQ62217 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sema5aQ62217 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sema5aQ62217 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sema5aQ62217 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sema5aQ62217 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Sema5aQ62217 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sema5aQ62217 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sema5aQ62217 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sema5aQ62217 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sema5aQ62217 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sema5aQ62217 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sema5aQ62217 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sema5aQ62217 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sema5aQ62217 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sema5aQ62217 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sema5aQ62217 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sema5aQ62217 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sema5aQ62217 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sema5aQ62217 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sema5aQ62217 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Sema5aQ62217 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Sema5aQ62217 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sema5aQ62217 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sema5aQ62217 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sema5aQ62217 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sema5aQ62217 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sema5aQ62217 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Sema5aQ62217 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sema5aQ62217 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Sema5aQ62217 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms