Protein–RNA interactions for Protein: Q62170

Selplg, P-selectin glycoprotein ligand 1, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelplgQ62170 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,13■□□□□ 0,81
SelplgQ62170 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20,13■□□□□ 0,81
SelplgQ62170 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,13■□□□□ 0,81
SelplgQ62170 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC20,13■□□□□ 0,81
SelplgQ62170 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20,12■□□□□ 0,81
SelplgQ62170 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,11■□□□□ 0,81
SelplgQ62170 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC20,11■□□□□ 0,81
SelplgQ62170 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,1■□□□□ 0,81
SelplgQ62170 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,09■□□□□ 0,81
SelplgQ62170 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,09■□□□□ 0,81
SelplgQ62170 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20,09■□□□□ 0,81
SelplgQ62170 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20,09■□□□□ 0,81
SelplgQ62170 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,08■□□□□ 0,81
SelplgQ62170 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,08■□□□□ 0,8
SelplgQ62170 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20,08■□□□□ 0,8
SelplgQ62170 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,07■□□□□ 0,8
SelplgQ62170 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20,07■□□□□ 0,8
SelplgQ62170 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC20,07■□□□□ 0,8
SelplgQ62170 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC20,06■□□□□ 0,8
SelplgQ62170 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20,06■□□□□ 0,8
SelplgQ62170 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,05■□□□□ 0,8
SelplgQ62170 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,04■□□□□ 0,8
SelplgQ62170 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,03■□□□□ 0,8
SelplgQ62170 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,02■□□□□ 0,8
SelplgQ62170 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,02■□□□□ 0,79
SelplgQ62170 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,01■□□□□ 0,79
SelplgQ62170 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,01■□□□□ 0,79
SelplgQ62170 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0,79
SelplgQ62170 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC19,99■□□□□ 0,79
SelplgQ62170 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC19,99■□□□□ 0,79
SelplgQ62170 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,97■□□□□ 0,79
SelplgQ62170 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,97■□□□□ 0,79
SelplgQ62170 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,97■□□□□ 0,79
SelplgQ62170 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,96■□□□□ 0,79
SelplgQ62170 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19,95■□□□□ 0,78
SelplgQ62170 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,94■□□□□ 0,78
SelplgQ62170 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19,94■□□□□ 0,78
SelplgQ62170 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,93■□□□□ 0,78
SelplgQ62170 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC19,92■□□□□ 0,78
SelplgQ62170 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,91■□□□□ 0,78
SelplgQ62170 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC19,91■□□□□ 0,78
SelplgQ62170 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,91■□□□□ 0,78
SelplgQ62170 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19,88■□□□□ 0,77
SelplgQ62170 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19,88■□□□□ 0,77
SelplgQ62170 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,87■□□□□ 0,77
SelplgQ62170 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC19,86■□□□□ 0,77
SelplgQ62170 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,86■□□□□ 0,77
SelplgQ62170 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC19,86■□□□□ 0,77
SelplgQ62170 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,85■□□□□ 0,77
SelplgQ62170 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,85■□□□□ 0,77
SelplgQ62170 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,84■□□□□ 0,77
SelplgQ62170 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,84■□□□□ 0,77
SelplgQ62170 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,84■□□□□ 0,77
SelplgQ62170 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,83■□□□□ 0,76
SelplgQ62170 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,82■□□□□ 0,76
SelplgQ62170 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,82■□□□□ 0,76
SelplgQ62170 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,82■□□□□ 0,76
SelplgQ62170 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC19,82■□□□□ 0,76
SelplgQ62170 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19,82■□□□□ 0,76
SelplgQ62170 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,81■□□□□ 0,76
SelplgQ62170 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,81■□□□□ 0,76
SelplgQ62170 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,8■□□□□ 0,76
SelplgQ62170 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,8■□□□□ 0,76
SelplgQ62170 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,78■□□□□ 0,76
SelplgQ62170 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,78■□□□□ 0,76
SelplgQ62170 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,78■□□□□ 0,76
SelplgQ62170 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC19,78■□□□□ 0,76
SelplgQ62170 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,78■□□□□ 0,76
SelplgQ62170 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,77■□□□□ 0,76
SelplgQ62170 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC19,76■□□□□ 0,75
SelplgQ62170 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19,76■□□□□ 0,75
SelplgQ62170 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,75■□□□□ 0,75
SelplgQ62170 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,75■□□□□ 0,75
SelplgQ62170 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,75■□□□□ 0,75
SelplgQ62170 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,73■□□□□ 0,75
SelplgQ62170 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,73■□□□□ 0,75
SelplgQ62170 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,72■□□□□ 0,75
SelplgQ62170 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,72■□□□□ 0,75
SelplgQ62170 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19,71■□□□□ 0,75
SelplgQ62170 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,7■□□□□ 0,74
SelplgQ62170 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,69■□□□□ 0,74
SelplgQ62170 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,69■□□□□ 0,74
SelplgQ62170 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19,68■□□□□ 0,74
SelplgQ62170 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,68■□□□□ 0,74
SelplgQ62170 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC19,67■□□□□ 0,74
SelplgQ62170 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,67■□□□□ 0,74
SelplgQ62170 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,67■□□□□ 0,74
SelplgQ62170 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,66■□□□□ 0,74
SelplgQ62170 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,66■□□□□ 0,74
SelplgQ62170 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,66■□□□□ 0,74
SelplgQ62170 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,64■□□□□ 0,73
SelplgQ62170 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,64■□□□□ 0,73
SelplgQ62170 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,63■□□□□ 0,73
SelplgQ62170 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,62■□□□□ 0,73
SelplgQ62170 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC19,61■□□□□ 0,73
SelplgQ62170 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,6■□□□□ 0,73
SelplgQ62170 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,6■□□□□ 0,73
SelplgQ62170 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19,6■□□□□ 0,73
SelplgQ62170 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19,59■□□□□ 0,73
SelplgQ62170 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,59■□□□□ 0,73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43,3 ms