Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TefmQ5SSK3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TefmQ5SSK3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TefmQ5SSK3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TefmQ5SSK3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TefmQ5SSK3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TefmQ5SSK3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TefmQ5SSK3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TefmQ5SSK3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TefmQ5SSK3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TefmQ5SSK3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TefmQ5SSK3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TefmQ5SSK3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TefmQ5SSK3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TefmQ5SSK3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TefmQ5SSK3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TefmQ5SSK3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TefmQ5SSK3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TefmQ5SSK3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TefmQ5SSK3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TefmQ5SSK3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TefmQ5SSK3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TefmQ5SSK3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TefmQ5SSK3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TefmQ5SSK3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TefmQ5SSK3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TefmQ5SSK3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TefmQ5SSK3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TefmQ5SSK3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TefmQ5SSK3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TefmQ5SSK3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TefmQ5SSK3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TefmQ5SSK3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TefmQ5SSK3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TefmQ5SSK3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TefmQ5SSK3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TefmQ5SSK3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TefmQ5SSK3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TefmQ5SSK3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TefmQ5SSK3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TefmQ5SSK3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TefmQ5SSK3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TefmQ5SSK3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TefmQ5SSK3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TefmQ5SSK3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TefmQ5SSK3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TefmQ5SSK3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TefmQ5SSK3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TefmQ5SSK3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TefmQ5SSK3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TefmQ5SSK3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TefmQ5SSK3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TefmQ5SSK3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TefmQ5SSK3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TefmQ5SSK3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TefmQ5SSK3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TefmQ5SSK3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TefmQ5SSK3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TefmQ5SSK3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TefmQ5SSK3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TefmQ5SSK3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TefmQ5SSK3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TefmQ5SSK3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TefmQ5SSK3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TefmQ5SSK3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TefmQ5SSK3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TefmQ5SSK3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TefmQ5SSK3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TefmQ5SSK3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TefmQ5SSK3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TefmQ5SSK3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TefmQ5SSK3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TefmQ5SSK3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TefmQ5SSK3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TefmQ5SSK3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TefmQ5SSK3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TefmQ5SSK3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TefmQ5SSK3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TefmQ5SSK3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TefmQ5SSK3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TefmQ5SSK3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TefmQ5SSK3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TefmQ5SSK3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TefmQ5SSK3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TefmQ5SSK3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TefmQ5SSK3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TefmQ5SSK3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TefmQ5SSK3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TefmQ5SSK3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TefmQ5SSK3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TefmQ5SSK3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TefmQ5SSK3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TefmQ5SSK3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TefmQ5SSK3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TefmQ5SSK3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TefmQ5SSK3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TefmQ5SSK3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TefmQ5SSK3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TefmQ5SSK3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TefmQ5SSK3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms