Protein–RNA interactions for Protein: Q5M6W3

Clhc1, Clathrin heavy chain linker domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clhc1Q5M6W3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Clhc1Q5M6W3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Clhc1Q5M6W3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Clhc1Q5M6W3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Clhc1Q5M6W3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Clhc1Q5M6W3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Clhc1Q5M6W3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Clhc1Q5M6W3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Clhc1Q5M6W3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Clhc1Q5M6W3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Clhc1Q5M6W3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Clhc1Q5M6W3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Clhc1Q5M6W3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Clhc1Q5M6W3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Clhc1Q5M6W3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Clhc1Q5M6W3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Clhc1Q5M6W3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Clhc1Q5M6W3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Clhc1Q5M6W3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Clhc1Q5M6W3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Clhc1Q5M6W3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Clhc1Q5M6W3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Clhc1Q5M6W3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Clhc1Q5M6W3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Clhc1Q5M6W3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Clhc1Q5M6W3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Clhc1Q5M6W3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Clhc1Q5M6W3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Clhc1Q5M6W3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Clhc1Q5M6W3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Clhc1Q5M6W3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Clhc1Q5M6W3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Clhc1Q5M6W3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Clhc1Q5M6W3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Clhc1Q5M6W3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Clhc1Q5M6W3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Clhc1Q5M6W3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Clhc1Q5M6W3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Clhc1Q5M6W3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Clhc1Q5M6W3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clhc1Q5M6W3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clhc1Q5M6W3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clhc1Q5M6W3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clhc1Q5M6W3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clhc1Q5M6W3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Clhc1Q5M6W3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Clhc1Q5M6W3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Clhc1Q5M6W3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Clhc1Q5M6W3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Clhc1Q5M6W3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Clhc1Q5M6W3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clhc1Q5M6W3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clhc1Q5M6W3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clhc1Q5M6W3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clhc1Q5M6W3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clhc1Q5M6W3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clhc1Q5M6W3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clhc1Q5M6W3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clhc1Q5M6W3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clhc1Q5M6W3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clhc1Q5M6W3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clhc1Q5M6W3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clhc1Q5M6W3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clhc1Q5M6W3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Clhc1Q5M6W3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clhc1Q5M6W3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clhc1Q5M6W3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clhc1Q5M6W3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Clhc1Q5M6W3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Clhc1Q5M6W3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clhc1Q5M6W3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clhc1Q5M6W3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clhc1Q5M6W3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clhc1Q5M6W3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clhc1Q5M6W3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clhc1Q5M6W3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clhc1Q5M6W3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Clhc1Q5M6W3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clhc1Q5M6W3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clhc1Q5M6W3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clhc1Q5M6W3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clhc1Q5M6W3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Clhc1Q5M6W3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Clhc1Q5M6W3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clhc1Q5M6W3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Clhc1Q5M6W3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clhc1Q5M6W3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clhc1Q5M6W3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clhc1Q5M6W3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clhc1Q5M6W3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Clhc1Q5M6W3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clhc1Q5M6W3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clhc1Q5M6W3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clhc1Q5M6W3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Clhc1Q5M6W3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clhc1Q5M6W3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clhc1Q5M6W3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clhc1Q5M6W3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clhc1Q5M6W3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clhc1Q5M6W3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1040.9 ms