Protein–RNA interactions for Protein: Q5I1X5

Ppp1r13l, RelA-associated inhibitor, mousemouse

Predictions only

Length 824 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r13lQ5I1X5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,01■■□□□ 1,75
Ppp1r13lQ5I1X5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
Ppp1r13lQ5I1X5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25,98■■□□□ 1,75
Ppp1r13lQ5I1X5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25,97■■□□□ 1,75
Ppp1r13lQ5I1X5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,96■■□□□ 1,75
Ppp1r13lQ5I1X5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,94■■□□□ 1,74
Ppp1r13lQ5I1X5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
Ppp1r13lQ5I1X5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
Ppp1r13lQ5I1X5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
Ppp1r13lQ5I1X5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
Ppp1r13lQ5I1X5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
Ppp1r13lQ5I1X5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
Ppp1r13lQ5I1X5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
Ppp1r13lQ5I1X5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,89■■□□□ 1,74
Ppp1r13lQ5I1X5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25,88■■□□□ 1,73
Ppp1r13lQ5I1X5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25,88■■□□□ 1,73
Ppp1r13lQ5I1X5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
Ppp1r13lQ5I1X5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
Ppp1r13lQ5I1X5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,86■■□□□ 1,73
Ppp1r13lQ5I1X5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Ppp1r13lQ5I1X5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Ppp1r13lQ5I1X5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,73
Ppp1r13lQ5I1X5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,73
Ppp1r13lQ5I1X5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,73
Ppp1r13lQ5I1X5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25,8■■□□□ 1,72
Ppp1r13lQ5I1X5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Ppp1r13lQ5I1X5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Ppp1r13lQ5I1X5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25,78■■□□□ 1,72
Ppp1r13lQ5I1X5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,75■■□□□ 1,71
Ppp1r13lQ5I1X5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25,74■■□□□ 1,71
Ppp1r13lQ5I1X5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25,72■■□□□ 1,71
Ppp1r13lQ5I1X5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Ppp1r13lQ5I1X5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25,7■■□□□ 1,7
Ppp1r13lQ5I1X5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,7
Ppp1r13lQ5I1X5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,7
Ppp1r13lQ5I1X5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,69■■□□□ 1,7
Ppp1r13lQ5I1X5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,69■■□□□ 1,7
Ppp1r13lQ5I1X5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Ppp1r13lQ5I1X5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Ppp1r13lQ5I1X5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Ppp1r13lQ5I1X5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25,66■■□□□ 1,7
Ppp1r13lQ5I1X5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,65■■□□□ 1,7
Ppp1r13lQ5I1X5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25,64■■□□□ 1,7
Ppp1r13lQ5I1X5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,7
Ppp1r13lQ5I1X5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,7
Ppp1r13lQ5I1X5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Ppp1r13lQ5I1X5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Ppp1r13lQ5I1X5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Ppp1r13lQ5I1X5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Ppp1r13lQ5I1X5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Ppp1r13lQ5I1X5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Ppp1r13lQ5I1X5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Ppp1r13lQ5I1X5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
Ppp1r13lQ5I1X5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25,57■■□□□ 1,68
Ppp1r13lQ5I1X5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25,56■■□□□ 1,68
Ppp1r13lQ5I1X5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Ppp1r13lQ5I1X5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Ppp1r13lQ5I1X5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25,55■■□□□ 1,68
Ppp1r13lQ5I1X5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Ppp1r13lQ5I1X5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Ppp1r13lQ5I1X5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,53■■□□□ 1,68
Ppp1r13lQ5I1X5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,51■■□□□ 1,67
Ppp1r13lQ5I1X5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Ppp1r13lQ5I1X5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Ppp1r13lQ5I1X5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,49■■□□□ 1,67
Ppp1r13lQ5I1X5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Ppp1r13lQ5I1X5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Ppp1r13lQ5I1X5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Ppp1r13lQ5I1X5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,45■■□□□ 1,67
Ppp1r13lQ5I1X5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Ppp1r13lQ5I1X5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25,45■■□□□ 1,66
Ppp1r13lQ5I1X5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Ppp1r13lQ5I1X5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Ppp1r13lQ5I1X5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Ppp1r13lQ5I1X5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Ppp1r13lQ5I1X5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Ppp1r13lQ5I1X5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Ppp1r13lQ5I1X5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Ppp1r13lQ5I1X5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Ppp1r13lQ5I1X5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25,38■■□□□ 1,65
Ppp1r13lQ5I1X5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Ppp1r13lQ5I1X5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Ppp1r13lQ5I1X5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Ppp1r13lQ5I1X5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25,35■■□□□ 1,65
Ppp1r13lQ5I1X5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Ppp1r13lQ5I1X5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Ppp1r13lQ5I1X5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Ppp1r13lQ5I1X5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Ppp1r13lQ5I1X5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Ppp1r13lQ5I1X5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Ppp1r13lQ5I1X5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Ppp1r13lQ5I1X5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,27■■□□□ 1,64
Ppp1r13lQ5I1X5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Ppp1r13lQ5I1X5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Ppp1r13lQ5I1X5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Ppp1r13lQ5I1X5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Ppp1r13lQ5I1X5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Ppp1r13lQ5I1X5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Ppp1r13lQ5I1X5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,22■■□□□ 1,63
Ppp1r13lQ5I1X5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25,21■■□□□ 1,63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,9 ms