Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKR2

Slc9b2, Sodium/hydrogen exchanger 9B2, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9b2Q5BKR2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Slc9b2Q5BKR2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Slc9b2Q5BKR2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Slc9b2Q5BKR2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Slc9b2Q5BKR2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Slc9b2Q5BKR2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Slc9b2Q5BKR2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Slc9b2Q5BKR2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Slc9b2Q5BKR2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Slc9b2Q5BKR2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Slc9b2Q5BKR2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Slc9b2Q5BKR2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Slc9b2Q5BKR2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Slc9b2Q5BKR2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Slc9b2Q5BKR2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Slc9b2Q5BKR2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Slc9b2Q5BKR2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Slc9b2Q5BKR2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Slc9b2Q5BKR2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Slc9b2Q5BKR2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Slc9b2Q5BKR2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Slc9b2Q5BKR2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Slc9b2Q5BKR2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Slc9b2Q5BKR2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Slc9b2Q5BKR2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Slc9b2Q5BKR2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Slc9b2Q5BKR2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Slc9b2Q5BKR2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Slc9b2Q5BKR2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Slc9b2Q5BKR2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Slc9b2Q5BKR2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Slc9b2Q5BKR2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Slc9b2Q5BKR2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Slc9b2Q5BKR2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Slc9b2Q5BKR2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Slc9b2Q5BKR2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Slc9b2Q5BKR2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Slc9b2Q5BKR2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Slc9b2Q5BKR2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Slc9b2Q5BKR2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Slc9b2Q5BKR2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Slc9b2Q5BKR2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Slc9b2Q5BKR2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Slc9b2Q5BKR2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Slc9b2Q5BKR2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Slc9b2Q5BKR2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Slc9b2Q5BKR2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Slc9b2Q5BKR2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Slc9b2Q5BKR2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Slc9b2Q5BKR2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Slc9b2Q5BKR2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Slc9b2Q5BKR2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Slc9b2Q5BKR2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Slc9b2Q5BKR2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Slc9b2Q5BKR2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Slc9b2Q5BKR2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Slc9b2Q5BKR2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Slc9b2Q5BKR2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Slc9b2Q5BKR2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Slc9b2Q5BKR2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Slc9b2Q5BKR2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Slc9b2Q5BKR2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Slc9b2Q5BKR2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Slc9b2Q5BKR2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Slc9b2Q5BKR2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Slc9b2Q5BKR2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Slc9b2Q5BKR2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Slc9b2Q5BKR2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Slc9b2Q5BKR2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Slc9b2Q5BKR2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Slc9b2Q5BKR2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Slc9b2Q5BKR2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Slc9b2Q5BKR2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Slc9b2Q5BKR2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Slc9b2Q5BKR2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Slc9b2Q5BKR2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Slc9b2Q5BKR2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Slc9b2Q5BKR2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Slc9b2Q5BKR2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Slc9b2Q5BKR2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Slc9b2Q5BKR2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Slc9b2Q5BKR2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Slc9b2Q5BKR2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Slc9b2Q5BKR2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Slc9b2Q5BKR2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Slc9b2Q5BKR2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Slc9b2Q5BKR2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Slc9b2Q5BKR2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Slc9b2Q5BKR2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Slc9b2Q5BKR2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Slc9b2Q5BKR2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Slc9b2Q5BKR2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Slc9b2Q5BKR2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Slc9b2Q5BKR2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Slc9b2Q5BKR2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Slc9b2Q5BKR2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Slc9b2Q5BKR2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Slc9b2Q5BKR2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Slc9b2Q5BKR2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Slc9b2Q5BKR2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms