Protein–RNA interactions for Protein: Q571B6

Whamm, WASP homolog-associated protein with actin, membranes and microtubules, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WhammQ571B6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
WhammQ571B6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
WhammQ571B6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
WhammQ571B6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
WhammQ571B6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
WhammQ571B6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
WhammQ571B6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
WhammQ571B6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
WhammQ571B6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
WhammQ571B6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
WhammQ571B6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
WhammQ571B6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
WhammQ571B6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
WhammQ571B6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
WhammQ571B6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
WhammQ571B6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
WhammQ571B6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
WhammQ571B6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
WhammQ571B6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
WhammQ571B6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
WhammQ571B6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
WhammQ571B6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
WhammQ571B6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
WhammQ571B6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
WhammQ571B6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
WhammQ571B6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
WhammQ571B6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
WhammQ571B6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
WhammQ571B6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
WhammQ571B6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
WhammQ571B6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
WhammQ571B6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
WhammQ571B6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
WhammQ571B6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
WhammQ571B6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
WhammQ571B6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
WhammQ571B6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
WhammQ571B6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
WhammQ571B6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
WhammQ571B6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
WhammQ571B6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
WhammQ571B6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
WhammQ571B6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
WhammQ571B6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
WhammQ571B6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
WhammQ571B6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
WhammQ571B6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
WhammQ571B6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
WhammQ571B6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
WhammQ571B6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
WhammQ571B6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
WhammQ571B6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
WhammQ571B6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24■■□□□ 1.43
WhammQ571B6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
WhammQ571B6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
WhammQ571B6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
WhammQ571B6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
WhammQ571B6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
WhammQ571B6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
WhammQ571B6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
WhammQ571B6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
WhammQ571B6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
WhammQ571B6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
WhammQ571B6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
WhammQ571B6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
WhammQ571B6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
WhammQ571B6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
WhammQ571B6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
WhammQ571B6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
WhammQ571B6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
WhammQ571B6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
WhammQ571B6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
WhammQ571B6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
WhammQ571B6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
WhammQ571B6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
WhammQ571B6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
WhammQ571B6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
WhammQ571B6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
WhammQ571B6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
WhammQ571B6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
WhammQ571B6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
WhammQ571B6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
WhammQ571B6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
WhammQ571B6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
WhammQ571B6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
WhammQ571B6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
WhammQ571B6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
WhammQ571B6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
WhammQ571B6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
WhammQ571B6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
WhammQ571B6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
WhammQ571B6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
WhammQ571B6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
WhammQ571B6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
WhammQ571B6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
WhammQ571B6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
WhammQ571B6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
WhammQ571B6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
WhammQ571B6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
WhammQ571B6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114 ms