Protein–RNA interactions for Protein: Q505D7

Opa3, Optic atrophy 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opa3Q505D7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Opa3Q505D7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Opa3Q505D7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Opa3Q505D7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Opa3Q505D7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Opa3Q505D7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Opa3Q505D7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Opa3Q505D7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Opa3Q505D7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Opa3Q505D7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Opa3Q505D7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Opa3Q505D7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Opa3Q505D7 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Opa3Q505D7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Opa3Q505D7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Opa3Q505D7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Opa3Q505D7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Opa3Q505D7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Opa3Q505D7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Opa3Q505D7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Opa3Q505D7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Opa3Q505D7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Opa3Q505D7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Opa3Q505D7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Opa3Q505D7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Opa3Q505D7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Opa3Q505D7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Opa3Q505D7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Opa3Q505D7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Opa3Q505D7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Opa3Q505D7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Opa3Q505D7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Opa3Q505D7 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Opa3Q505D7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Opa3Q505D7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Opa3Q505D7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Opa3Q505D7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Opa3Q505D7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Opa3Q505D7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Opa3Q505D7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Opa3Q505D7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Opa3Q505D7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Opa3Q505D7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Opa3Q505D7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Opa3Q505D7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Opa3Q505D7 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Opa3Q505D7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Opa3Q505D7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Opa3Q505D7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Opa3Q505D7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Opa3Q505D7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Opa3Q505D7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Opa3Q505D7 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Opa3Q505D7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Opa3Q505D7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Opa3Q505D7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Opa3Q505D7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Opa3Q505D7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Opa3Q505D7 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Opa3Q505D7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Opa3Q505D7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Opa3Q505D7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Opa3Q505D7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Opa3Q505D7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Opa3Q505D7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Opa3Q505D7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Opa3Q505D7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Opa3Q505D7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Opa3Q505D7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Opa3Q505D7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Opa3Q505D7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Opa3Q505D7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Opa3Q505D7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Opa3Q505D7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Opa3Q505D7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Opa3Q505D7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Opa3Q505D7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Opa3Q505D7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Opa3Q505D7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Opa3Q505D7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Opa3Q505D7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Opa3Q505D7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Opa3Q505D7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Opa3Q505D7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Opa3Q505D7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Opa3Q505D7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Opa3Q505D7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Opa3Q505D7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Opa3Q505D7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Opa3Q505D7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Opa3Q505D7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Opa3Q505D7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Opa3Q505D7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Opa3Q505D7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Opa3Q505D7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Opa3Q505D7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Opa3Q505D7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Opa3Q505D7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Opa3Q505D7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Opa3Q505D7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms