Protein–RNA interactions for Protein: Q497K7

Tmem247, Transmembrane protein 247, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem247Q497K7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Tmem247Q497K7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmem247Q497K7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tmem247Q497K7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tmem247Q497K7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tmem247Q497K7 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tmem247Q497K7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tmem247Q497K7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tmem247Q497K7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Tmem247Q497K7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tmem247Q497K7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tmem247Q497K7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tmem247Q497K7 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Tmem247Q497K7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tmem247Q497K7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tmem247Q497K7 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tmem247Q497K7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Tmem247Q497K7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tmem247Q497K7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tmem247Q497K7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Tmem247Q497K7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tmem247Q497K7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tmem247Q497K7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tmem247Q497K7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tmem247Q497K7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tmem247Q497K7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tmem247Q497K7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tmem247Q497K7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tmem247Q497K7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tmem247Q497K7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tmem247Q497K7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Tmem247Q497K7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tmem247Q497K7 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tmem247Q497K7 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tmem247Q497K7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tmem247Q497K7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Tmem247Q497K7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tmem247Q497K7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tmem247Q497K7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tmem247Q497K7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tmem247Q497K7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tmem247Q497K7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tmem247Q497K7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tmem247Q497K7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tmem247Q497K7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tmem247Q497K7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tmem247Q497K7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tmem247Q497K7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tmem247Q497K7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tmem247Q497K7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tmem247Q497K7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tmem247Q497K7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tmem247Q497K7 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Tmem247Q497K7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Tmem247Q497K7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tmem247Q497K7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tmem247Q497K7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tmem247Q497K7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Tmem247Q497K7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Tmem247Q497K7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmem247Q497K7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmem247Q497K7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmem247Q497K7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmem247Q497K7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmem247Q497K7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmem247Q497K7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmem247Q497K7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmem247Q497K7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmem247Q497K7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmem247Q497K7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmem247Q497K7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tmem247Q497K7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tmem247Q497K7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmem247Q497K7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmem247Q497K7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmem247Q497K7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmem247Q497K7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmem247Q497K7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmem247Q497K7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmem247Q497K7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmem247Q497K7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmem247Q497K7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmem247Q497K7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmem247Q497K7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmem247Q497K7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmem247Q497K7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmem247Q497K7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmem247Q497K7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmem247Q497K7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmem247Q497K7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmem247Q497K7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tmem247Q497K7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmem247Q497K7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmem247Q497K7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmem247Q497K7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmem247Q497K7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmem247Q497K7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tmem247Q497K7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tmem247Q497K7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmem247Q497K7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms