Protein–RNA interactions for Protein: Q3V172

Sel1l2, Protein sel-1 homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sel1l2Q3V172 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Sel1l2Q3V172 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sel1l2Q3V172 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sel1l2Q3V172 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sel1l2Q3V172 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sel1l2Q3V172 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Sel1l2Q3V172 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sel1l2Q3V172 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sel1l2Q3V172 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sel1l2Q3V172 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sel1l2Q3V172 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sel1l2Q3V172 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sel1l2Q3V172 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sel1l2Q3V172 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Sel1l2Q3V172 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sel1l2Q3V172 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sel1l2Q3V172 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sel1l2Q3V172 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sel1l2Q3V172 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Sel1l2Q3V172 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sel1l2Q3V172 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sel1l2Q3V172 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sel1l2Q3V172 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sel1l2Q3V172 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sel1l2Q3V172 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sel1l2Q3V172 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sel1l2Q3V172 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sel1l2Q3V172 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sel1l2Q3V172 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sel1l2Q3V172 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sel1l2Q3V172 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sel1l2Q3V172 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sel1l2Q3V172 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sel1l2Q3V172 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sel1l2Q3V172 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Sel1l2Q3V172 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sel1l2Q3V172 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sel1l2Q3V172 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sel1l2Q3V172 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sel1l2Q3V172 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sel1l2Q3V172 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sel1l2Q3V172 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sel1l2Q3V172 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sel1l2Q3V172 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sel1l2Q3V172 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sel1l2Q3V172 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sel1l2Q3V172 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sel1l2Q3V172 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sel1l2Q3V172 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Sel1l2Q3V172 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sel1l2Q3V172 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Sel1l2Q3V172 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Sel1l2Q3V172 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sel1l2Q3V172 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sel1l2Q3V172 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sel1l2Q3V172 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sel1l2Q3V172 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sel1l2Q3V172 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sel1l2Q3V172 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sel1l2Q3V172 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sel1l2Q3V172 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sel1l2Q3V172 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sel1l2Q3V172 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sel1l2Q3V172 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sel1l2Q3V172 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sel1l2Q3V172 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sel1l2Q3V172 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sel1l2Q3V172 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sel1l2Q3V172 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sel1l2Q3V172 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sel1l2Q3V172 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sel1l2Q3V172 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sel1l2Q3V172 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sel1l2Q3V172 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sel1l2Q3V172 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sel1l2Q3V172 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sel1l2Q3V172 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sel1l2Q3V172 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sel1l2Q3V172 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sel1l2Q3V172 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sel1l2Q3V172 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sel1l2Q3V172 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sel1l2Q3V172 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sel1l2Q3V172 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sel1l2Q3V172 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sel1l2Q3V172 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sel1l2Q3V172 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sel1l2Q3V172 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Sel1l2Q3V172 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Sel1l2Q3V172 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sel1l2Q3V172 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sel1l2Q3V172 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sel1l2Q3V172 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sel1l2Q3V172 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sel1l2Q3V172 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sel1l2Q3V172 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sel1l2Q3V172 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sel1l2Q3V172 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sel1l2Q3V172 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sel1l2Q3V172 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms