Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Ccdc27Q3V036 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
Ccdc27Q3V036 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Ccdc27Q3V036 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Ccdc27Q3V036 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Ccdc27Q3V036 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Ccdc27Q3V036 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Ccdc27Q3V036 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Ccdc27Q3V036 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
Ccdc27Q3V036 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Ccdc27Q3V036 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Ccdc27Q3V036 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Ccdc27Q3V036 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Ccdc27Q3V036 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Ccdc27Q3V036 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Ccdc27Q3V036 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Ccdc27Q3V036 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
Ccdc27Q3V036 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Ccdc27Q3V036 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Ccdc27Q3V036 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Ccdc27Q3V036 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Ccdc27Q3V036 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Ccdc27Q3V036 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Ccdc27Q3V036 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Ccdc27Q3V036 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Ccdc27Q3V036 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Ccdc27Q3V036 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
Ccdc27Q3V036 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
Ccdc27Q3V036 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Ccdc27Q3V036 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Ccdc27Q3V036 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Ccdc27Q3V036 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
Ccdc27Q3V036 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Ccdc27Q3V036 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Ccdc27Q3V036 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Ccdc27Q3V036 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC32.45■■■□□ 2.78
Ccdc27Q3V036 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Ccdc27Q3V036 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
Ccdc27Q3V036 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Ccdc27Q3V036 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Ccdc27Q3V036 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Ccdc27Q3V036 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Ccdc27Q3V036 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Ccdc27Q3V036 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Ccdc27Q3V036 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Ccdc27Q3V036 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
Ccdc27Q3V036 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Ccdc27Q3V036 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Ccdc27Q3V036 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Ccdc27Q3V036 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Ccdc27Q3V036 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Ccdc27Q3V036 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Ccdc27Q3V036 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Ccdc27Q3V036 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
Ccdc27Q3V036 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Ccdc27Q3V036 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Ccdc27Q3V036 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Ccdc27Q3V036 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Ccdc27Q3V036 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Ccdc27Q3V036 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
Ccdc27Q3V036 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Ccdc27Q3V036 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Ccdc27Q3V036 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Ccdc27Q3V036 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Ccdc27Q3V036 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Ccdc27Q3V036 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
Ccdc27Q3V036 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Ccdc27Q3V036 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Ccdc27Q3V036 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Ccdc27Q3V036 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Ccdc27Q3V036 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Ccdc27Q3V036 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Ccdc27Q3V036 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Ccdc27Q3V036 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Ccdc27Q3V036 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Ccdc27Q3V036 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Ccdc27Q3V036 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Ccdc27Q3V036 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Ccdc27Q3V036 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Ccdc27Q3V036 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Ccdc27Q3V036 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Ccdc27Q3V036 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Ccdc27Q3V036 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Ccdc27Q3V036 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
Ccdc27Q3V036 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Ccdc27Q3V036 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Ccdc27Q3V036 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Ccdc27Q3V036 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Ccdc27Q3V036 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Ccdc27Q3V036 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Ccdc27Q3V036 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Ccdc27Q3V036 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Ccdc27Q3V036 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Ccdc27Q3V036 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Ccdc27Q3V036 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Ccdc27Q3V036 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Ccdc27Q3V036 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Ccdc27Q3V036 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Ccdc27Q3V036 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Ccdc27Q3V036 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms