Protein–RNA interactions for Protein: Q3UY51

Lrrc55, Leucine-rich repeat-containing protein 55, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc55Q3UY51 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Lrrc55Q3UY51 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Lrrc55Q3UY51 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Lrrc55Q3UY51 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Lrrc55Q3UY51 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Lrrc55Q3UY51 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Lrrc55Q3UY51 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Lrrc55Q3UY51 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Lrrc55Q3UY51 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Lrrc55Q3UY51 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Lrrc55Q3UY51 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Lrrc55Q3UY51 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Lrrc55Q3UY51 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Lrrc55Q3UY51 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Lrrc55Q3UY51 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Lrrc55Q3UY51 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Lrrc55Q3UY51 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Lrrc55Q3UY51 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Lrrc55Q3UY51 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Lrrc55Q3UY51 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Lrrc55Q3UY51 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Lrrc55Q3UY51 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Lrrc55Q3UY51 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Lrrc55Q3UY51 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Lrrc55Q3UY51 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Lrrc55Q3UY51 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Lrrc55Q3UY51 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Lrrc55Q3UY51 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Lrrc55Q3UY51 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Lrrc55Q3UY51 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Lrrc55Q3UY51 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Lrrc55Q3UY51 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Lrrc55Q3UY51 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Lrrc55Q3UY51 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Lrrc55Q3UY51 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Lrrc55Q3UY51 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Lrrc55Q3UY51 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Lrrc55Q3UY51 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Lrrc55Q3UY51 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Lrrc55Q3UY51 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Lrrc55Q3UY51 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Lrrc55Q3UY51 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Lrrc55Q3UY51 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Lrrc55Q3UY51 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Lrrc55Q3UY51 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Lrrc55Q3UY51 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Lrrc55Q3UY51 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Lrrc55Q3UY51 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Lrrc55Q3UY51 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Lrrc55Q3UY51 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Lrrc55Q3UY51 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Lrrc55Q3UY51 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Lrrc55Q3UY51 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Lrrc55Q3UY51 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Lrrc55Q3UY51 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Lrrc55Q3UY51 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Lrrc55Q3UY51 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Lrrc55Q3UY51 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Lrrc55Q3UY51 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
Lrrc55Q3UY51 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Lrrc55Q3UY51 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Lrrc55Q3UY51 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Lrrc55Q3UY51 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Lrrc55Q3UY51 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Lrrc55Q3UY51 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Lrrc55Q3UY51 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Lrrc55Q3UY51 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Lrrc55Q3UY51 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Lrrc55Q3UY51 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Lrrc55Q3UY51 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Lrrc55Q3UY51 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Lrrc55Q3UY51 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Lrrc55Q3UY51 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Lrrc55Q3UY51 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Lrrc55Q3UY51 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Lrrc55Q3UY51 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Lrrc55Q3UY51 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Lrrc55Q3UY51 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Lrrc55Q3UY51 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Lrrc55Q3UY51 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Lrrc55Q3UY51 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Lrrc55Q3UY51 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Lrrc55Q3UY51 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Lrrc55Q3UY51 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Lrrc55Q3UY51 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Lrrc55Q3UY51 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Lrrc55Q3UY51 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Lrrc55Q3UY51 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Lrrc55Q3UY51 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Lrrc55Q3UY51 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Lrrc55Q3UY51 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Lrrc55Q3UY51 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Lrrc55Q3UY51 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Lrrc55Q3UY51 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Lrrc55Q3UY51 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Lrrc55Q3UY51 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Lrrc55Q3UY51 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Lrrc55Q3UY51 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Lrrc55Q3UY51 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Lrrc55Q3UY51 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms