Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUX7

Uncharacterized protein C4orf46 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UUX7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Q3UUX7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q3UUX7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Q3UUX7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q3UUX7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q3UUX7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Q3UUX7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q3UUX7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q3UUX7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q3UUX7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q3UUX7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q3UUX7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q3UUX7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q3UUX7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q3UUX7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q3UUX7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q3UUX7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q3UUX7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q3UUX7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q3UUX7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q3UUX7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q3UUX7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q3UUX7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q3UUX7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q3UUX7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Q3UUX7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Q3UUX7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Q3UUX7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q3UUX7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q3UUX7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q3UUX7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q3UUX7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q3UUX7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q3UUX7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q3UUX7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q3UUX7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q3UUX7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q3UUX7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q3UUX7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q3UUX7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q3UUX7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q3UUX7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q3UUX7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q3UUX7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q3UUX7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q3UUX7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q3UUX7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q3UUX7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q3UUX7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q3UUX7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q3UUX7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q3UUX7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q3UUX7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q3UUX7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q3UUX7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q3UUX7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q3UUX7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q3UUX7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q3UUX7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q3UUX7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q3UUX7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q3UUX7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q3UUX7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q3UUX7 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Q3UUX7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q3UUX7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q3UUX7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q3UUX7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q3UUX7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q3UUX7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q3UUX7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q3UUX7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Q3UUX7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q3UUX7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q3UUX7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q3UUX7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q3UUX7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q3UUX7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q3UUX7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q3UUX7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q3UUX7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q3UUX7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q3UUX7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q3UUX7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q3UUX7 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q3UUX7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q3UUX7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Q3UUX7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q3UUX7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q3UUX7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q3UUX7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q3UUX7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q3UUX7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q3UUX7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q3UUX7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q3UUX7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q3UUX7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q3UUX7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q3UUX7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q3UUX7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 149 ms