Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMW8

Cln5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln5Q3UMW8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cln5Q3UMW8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cln5Q3UMW8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cln5Q3UMW8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cln5Q3UMW8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cln5Q3UMW8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cln5Q3UMW8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cln5Q3UMW8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cln5Q3UMW8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cln5Q3UMW8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cln5Q3UMW8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cln5Q3UMW8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cln5Q3UMW8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cln5Q3UMW8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cln5Q3UMW8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cln5Q3UMW8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cln5Q3UMW8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cln5Q3UMW8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cln5Q3UMW8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cln5Q3UMW8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cln5Q3UMW8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cln5Q3UMW8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cln5Q3UMW8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cln5Q3UMW8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cln5Q3UMW8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cln5Q3UMW8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cln5Q3UMW8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cln5Q3UMW8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cln5Q3UMW8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cln5Q3UMW8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cln5Q3UMW8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cln5Q3UMW8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cln5Q3UMW8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cln5Q3UMW8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cln5Q3UMW8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cln5Q3UMW8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cln5Q3UMW8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cln5Q3UMW8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cln5Q3UMW8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cln5Q3UMW8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cln5Q3UMW8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cln5Q3UMW8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cln5Q3UMW8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cln5Q3UMW8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Cln5Q3UMW8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cln5Q3UMW8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cln5Q3UMW8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cln5Q3UMW8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cln5Q3UMW8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cln5Q3UMW8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cln5Q3UMW8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cln5Q3UMW8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Cln5Q3UMW8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cln5Q3UMW8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cln5Q3UMW8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cln5Q3UMW8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cln5Q3UMW8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cln5Q3UMW8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cln5Q3UMW8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cln5Q3UMW8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cln5Q3UMW8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cln5Q3UMW8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cln5Q3UMW8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cln5Q3UMW8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cln5Q3UMW8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cln5Q3UMW8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cln5Q3UMW8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cln5Q3UMW8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cln5Q3UMW8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cln5Q3UMW8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cln5Q3UMW8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cln5Q3UMW8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cln5Q3UMW8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cln5Q3UMW8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cln5Q3UMW8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cln5Q3UMW8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cln5Q3UMW8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cln5Q3UMW8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cln5Q3UMW8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cln5Q3UMW8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cln5Q3UMW8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cln5Q3UMW8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cln5Q3UMW8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cln5Q3UMW8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cln5Q3UMW8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cln5Q3UMW8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cln5Q3UMW8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cln5Q3UMW8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cln5Q3UMW8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cln5Q3UMW8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cln5Q3UMW8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cln5Q3UMW8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cln5Q3UMW8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cln5Q3UMW8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cln5Q3UMW8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cln5Q3UMW8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cln5Q3UMW8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cln5Q3UMW8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cln5Q3UMW8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cln5Q3UMW8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
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