Protein–RNA interactions for Protein: Q3UME2

Tmem241, Transmembrane protein 241, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem241Q3UME2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tmem241Q3UME2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tmem241Q3UME2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tmem241Q3UME2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tmem241Q3UME2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tmem241Q3UME2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmem241Q3UME2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmem241Q3UME2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmem241Q3UME2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmem241Q3UME2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmem241Q3UME2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmem241Q3UME2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmem241Q3UME2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmem241Q3UME2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmem241Q3UME2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmem241Q3UME2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmem241Q3UME2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmem241Q3UME2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmem241Q3UME2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmem241Q3UME2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmem241Q3UME2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmem241Q3UME2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmem241Q3UME2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmem241Q3UME2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmem241Q3UME2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmem241Q3UME2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmem241Q3UME2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmem241Q3UME2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmem241Q3UME2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmem241Q3UME2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmem241Q3UME2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmem241Q3UME2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmem241Q3UME2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmem241Q3UME2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmem241Q3UME2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmem241Q3UME2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmem241Q3UME2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmem241Q3UME2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmem241Q3UME2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmem241Q3UME2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmem241Q3UME2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmem241Q3UME2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmem241Q3UME2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmem241Q3UME2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmem241Q3UME2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmem241Q3UME2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmem241Q3UME2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmem241Q3UME2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tmem241Q3UME2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmem241Q3UME2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmem241Q3UME2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmem241Q3UME2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmem241Q3UME2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmem241Q3UME2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmem241Q3UME2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmem241Q3UME2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmem241Q3UME2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmem241Q3UME2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmem241Q3UME2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmem241Q3UME2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmem241Q3UME2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmem241Q3UME2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmem241Q3UME2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmem241Q3UME2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tmem241Q3UME2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmem241Q3UME2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmem241Q3UME2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tmem241Q3UME2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmem241Q3UME2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmem241Q3UME2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmem241Q3UME2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmem241Q3UME2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmem241Q3UME2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmem241Q3UME2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmem241Q3UME2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmem241Q3UME2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmem241Q3UME2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmem241Q3UME2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmem241Q3UME2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmem241Q3UME2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmem241Q3UME2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmem241Q3UME2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmem241Q3UME2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmem241Q3UME2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmem241Q3UME2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmem241Q3UME2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmem241Q3UME2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmem241Q3UME2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmem241Q3UME2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmem241Q3UME2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmem241Q3UME2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmem241Q3UME2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmem241Q3UME2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmem241Q3UME2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmem241Q3UME2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmem241Q3UME2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmem241Q3UME2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmem241Q3UME2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmem241Q3UME2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmem241Q3UME2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117 ms