Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW5

Rnf10, RING finger protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf10Q3UIW5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rnf10Q3UIW5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rnf10Q3UIW5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rnf10Q3UIW5 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rnf10Q3UIW5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rnf10Q3UIW5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rnf10Q3UIW5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Rnf10Q3UIW5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rnf10Q3UIW5 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rnf10Q3UIW5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Rnf10Q3UIW5 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rnf10Q3UIW5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rnf10Q3UIW5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.51■■■□□ 2
Rnf10Q3UIW5 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Rnf10Q3UIW5 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rnf10Q3UIW5 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rnf10Q3UIW5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rnf10Q3UIW5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rnf10Q3UIW5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rnf10Q3UIW5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rnf10Q3UIW5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rnf10Q3UIW5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rnf10Q3UIW5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rnf10Q3UIW5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rnf10Q3UIW5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rnf10Q3UIW5 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rnf10Q3UIW5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rnf10Q3UIW5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rnf10Q3UIW5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rnf10Q3UIW5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rnf10Q3UIW5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rnf10Q3UIW5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rnf10Q3UIW5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rnf10Q3UIW5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rnf10Q3UIW5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Rnf10Q3UIW5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Rnf10Q3UIW5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rnf10Q3UIW5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rnf10Q3UIW5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rnf10Q3UIW5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rnf10Q3UIW5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Rnf10Q3UIW5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Rnf10Q3UIW5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rnf10Q3UIW5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rnf10Q3UIW5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rnf10Q3UIW5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rnf10Q3UIW5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rnf10Q3UIW5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rnf10Q3UIW5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Rnf10Q3UIW5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rnf10Q3UIW5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Rnf10Q3UIW5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rnf10Q3UIW5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Rnf10Q3UIW5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rnf10Q3UIW5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rnf10Q3UIW5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rnf10Q3UIW5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rnf10Q3UIW5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rnf10Q3UIW5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rnf10Q3UIW5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rnf10Q3UIW5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rnf10Q3UIW5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rnf10Q3UIW5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rnf10Q3UIW5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rnf10Q3UIW5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rnf10Q3UIW5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rnf10Q3UIW5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rnf10Q3UIW5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rnf10Q3UIW5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rnf10Q3UIW5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Rnf10Q3UIW5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Rnf10Q3UIW5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rnf10Q3UIW5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rnf10Q3UIW5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rnf10Q3UIW5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rnf10Q3UIW5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rnf10Q3UIW5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rnf10Q3UIW5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rnf10Q3UIW5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Rnf10Q3UIW5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rnf10Q3UIW5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Rnf10Q3UIW5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rnf10Q3UIW5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rnf10Q3UIW5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rnf10Q3UIW5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rnf10Q3UIW5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rnf10Q3UIW5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rnf10Q3UIW5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rnf10Q3UIW5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rnf10Q3UIW5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Rnf10Q3UIW5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rnf10Q3UIW5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rnf10Q3UIW5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rnf10Q3UIW5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rnf10Q3UIW5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rnf10Q3UIW5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rnf10Q3UIW5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rnf10Q3UIW5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rnf10Q3UIW5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rnf10Q3UIW5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms