Protein–RNA interactions for Protein: Q3U487

Hectd3, E3 ubiquitin-protein ligase HECTD3, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hectd3Q3U487 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hectd3Q3U487 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Hectd3Q3U487 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hectd3Q3U487 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hectd3Q3U487 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hectd3Q3U487 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hectd3Q3U487 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hectd3Q3U487 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hectd3Q3U487 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hectd3Q3U487 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hectd3Q3U487 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hectd3Q3U487 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hectd3Q3U487 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hectd3Q3U487 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hectd3Q3U487 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Hectd3Q3U487 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hectd3Q3U487 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hectd3Q3U487 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hectd3Q3U487 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hectd3Q3U487 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hectd3Q3U487 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hectd3Q3U487 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hectd3Q3U487 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hectd3Q3U487 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hectd3Q3U487 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hectd3Q3U487 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hectd3Q3U487 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hectd3Q3U487 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hectd3Q3U487 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hectd3Q3U487 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hectd3Q3U487 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hectd3Q3U487 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hectd3Q3U487 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hectd3Q3U487 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hectd3Q3U487 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hectd3Q3U487 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hectd3Q3U487 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hectd3Q3U487 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hectd3Q3U487 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hectd3Q3U487 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hectd3Q3U487 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hectd3Q3U487 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hectd3Q3U487 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hectd3Q3U487 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hectd3Q3U487 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hectd3Q3U487 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hectd3Q3U487 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hectd3Q3U487 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Hectd3Q3U487 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hectd3Q3U487 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hectd3Q3U487 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hectd3Q3U487 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hectd3Q3U487 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hectd3Q3U487 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hectd3Q3U487 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hectd3Q3U487 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hectd3Q3U487 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hectd3Q3U487 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hectd3Q3U487 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hectd3Q3U487 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hectd3Q3U487 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hectd3Q3U487 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hectd3Q3U487 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hectd3Q3U487 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hectd3Q3U487 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hectd3Q3U487 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Hectd3Q3U487 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Hectd3Q3U487 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hectd3Q3U487 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hectd3Q3U487 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hectd3Q3U487 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hectd3Q3U487 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hectd3Q3U487 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hectd3Q3U487 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hectd3Q3U487 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hectd3Q3U487 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hectd3Q3U487 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hectd3Q3U487 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hectd3Q3U487 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hectd3Q3U487 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hectd3Q3U487 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hectd3Q3U487 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hectd3Q3U487 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hectd3Q3U487 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hectd3Q3U487 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hectd3Q3U487 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hectd3Q3U487 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hectd3Q3U487 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hectd3Q3U487 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Hectd3Q3U487 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hectd3Q3U487 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Hectd3Q3U487 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hectd3Q3U487 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hectd3Q3U487 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hectd3Q3U487 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hectd3Q3U487 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hectd3Q3U487 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hectd3Q3U487 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hectd3Q3U487 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hectd3Q3U487 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms