Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K0

Fam193b, Protein FAM193B, mousemouse

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam193bQ3U2K0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Fam193bQ3U2K0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
Fam193bQ3U2K0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,75■■■□□ 2,03
Fam193bQ3U2K0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
Fam193bQ3U2K0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27,72■■■□□ 2,03
Fam193bQ3U2K0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27,72■■■□□ 2,03
Fam193bQ3U2K0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Fam193bQ3U2K0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27,71■■■□□ 2,03
Fam193bQ3U2K0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
Fam193bQ3U2K0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
Fam193bQ3U2K0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,03
Fam193bQ3U2K0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,02
Fam193bQ3U2K0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
Fam193bQ3U2K0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Fam193bQ3U2K0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Fam193bQ3U2K0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Fam193bQ3U2K0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,63■■■□□ 2,01
Fam193bQ3U2K0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
Fam193bQ3U2K0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
Fam193bQ3U2K0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27,58■■■□□ 2,01
Fam193bQ3U2K0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Fam193bQ3U2K0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,57■■■□□ 2
Fam193bQ3U2K0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27,57■■■□□ 2
Fam193bQ3U2K0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
Fam193bQ3U2K0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
Fam193bQ3U2K0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27,53■■■□□ 2
Fam193bQ3U2K0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,51■■□□□ 1,99
Fam193bQ3U2K0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
Fam193bQ3U2K0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
Fam193bQ3U2K0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,44■■□□□ 1,98
Fam193bQ3U2K0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27,44■■□□□ 1,98
Fam193bQ3U2K0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
Fam193bQ3U2K0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27,42■■□□□ 1,98
Fam193bQ3U2K0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27,42■■□□□ 1,98
Fam193bQ3U2K0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27,39■■□□□ 1,98
Fam193bQ3U2K0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Fam193bQ3U2K0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Fam193bQ3U2K0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27,37■■□□□ 1,97
Fam193bQ3U2K0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27,37■■□□□ 1,97
Fam193bQ3U2K0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Fam193bQ3U2K0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,97
Fam193bQ3U2K0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
Fam193bQ3U2K0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
Fam193bQ3U2K0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
Fam193bQ3U2K0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,3■■□□□ 1,96
Fam193bQ3U2K0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
Fam193bQ3U2K0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27,28■■□□□ 1,96
Fam193bQ3U2K0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
Fam193bQ3U2K0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
Fam193bQ3U2K0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27,26■■□□□ 1,95
Fam193bQ3U2K0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
Fam193bQ3U2K0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
Fam193bQ3U2K0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
Fam193bQ3U2K0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27,24■■□□□ 1,95
Fam193bQ3U2K0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Fam193bQ3U2K0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27,23■■□□□ 1,95
Fam193bQ3U2K0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Fam193bQ3U2K0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
Fam193bQ3U2K0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
Fam193bQ3U2K0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,2■■□□□ 1,95
Fam193bQ3U2K0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27,19■■□□□ 1,94
Fam193bQ3U2K0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27,18■■□□□ 1,94
Fam193bQ3U2K0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27,18■■□□□ 1,94
Fam193bQ3U2K0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
Fam193bQ3U2K0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Fam193bQ3U2K0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27,17■■□□□ 1,94
Fam193bQ3U2K0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,94
Fam193bQ3U2K0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,94
Fam193bQ3U2K0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,93
Fam193bQ3U2K0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,93
Fam193bQ3U2K0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
Fam193bQ3U2K0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
Fam193bQ3U2K0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
Fam193bQ3U2K0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Fam193bQ3U2K0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Fam193bQ3U2K0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Fam193bQ3U2K0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Fam193bQ3U2K0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Fam193bQ3U2K0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Fam193bQ3U2K0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Fam193bQ3U2K0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
Fam193bQ3U2K0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27,03■■□□□ 1,92
Fam193bQ3U2K0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Fam193bQ3U2K0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Fam193bQ3U2K0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Fam193bQ3U2K0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Fam193bQ3U2K0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Fam193bQ3U2K0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,01■■□□□ 1,92
Fam193bQ3U2K0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Fam193bQ3U2K0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
Fam193bQ3U2K0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
Fam193bQ3U2K0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
Fam193bQ3U2K0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,9
Fam193bQ3U2K0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Fam193bQ3U2K0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Fam193bQ3U2K0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
Fam193bQ3U2K0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Fam193bQ3U2K0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26,91■■□□□ 1,9
Fam193bQ3U2K0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
Fam193bQ3U2K0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17,2 ms