Protein–RNA interactions for Protein: Q3U108

Arid5a, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, mousemouse

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arid5aQ3U108 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Arid5aQ3U108 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Arid5aQ3U108 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Arid5aQ3U108 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Arid5aQ3U108 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Arid5aQ3U108 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Arid5aQ3U108 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Arid5aQ3U108 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Arid5aQ3U108 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Arid5aQ3U108 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Arid5aQ3U108 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Arid5aQ3U108 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Arid5aQ3U108 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Arid5aQ3U108 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Arid5aQ3U108 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Arid5aQ3U108 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Arid5aQ3U108 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Arid5aQ3U108 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Arid5aQ3U108 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Arid5aQ3U108 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Arid5aQ3U108 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Arid5aQ3U108 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Arid5aQ3U108 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Arid5aQ3U108 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Arid5aQ3U108 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Arid5aQ3U108 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Arid5aQ3U108 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Arid5aQ3U108 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Arid5aQ3U108 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Arid5aQ3U108 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Arid5aQ3U108 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Arid5aQ3U108 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Arid5aQ3U108 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Arid5aQ3U108 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Arid5aQ3U108 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Arid5aQ3U108 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Arid5aQ3U108 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Arid5aQ3U108 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Arid5aQ3U108 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Arid5aQ3U108 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Arid5aQ3U108 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Arid5aQ3U108 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Arid5aQ3U108 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Arid5aQ3U108 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Arid5aQ3U108 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Arid5aQ3U108 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Arid5aQ3U108 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Arid5aQ3U108 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Arid5aQ3U108 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Arid5aQ3U108 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Arid5aQ3U108 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Arid5aQ3U108 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Arid5aQ3U108 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Arid5aQ3U108 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Arid5aQ3U108 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Arid5aQ3U108 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Arid5aQ3U108 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Arid5aQ3U108 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Arid5aQ3U108 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Arid5aQ3U108 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Arid5aQ3U108 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Arid5aQ3U108 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Arid5aQ3U108 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Arid5aQ3U108 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Arid5aQ3U108 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Arid5aQ3U108 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Arid5aQ3U108 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Arid5aQ3U108 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Arid5aQ3U108 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Arid5aQ3U108 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Arid5aQ3U108 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Arid5aQ3U108 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Arid5aQ3U108 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Arid5aQ3U108 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Arid5aQ3U108 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Arid5aQ3U108 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Arid5aQ3U108 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Arid5aQ3U108 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Arid5aQ3U108 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Arid5aQ3U108 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Arid5aQ3U108 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Arid5aQ3U108 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Arid5aQ3U108 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Arid5aQ3U108 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Arid5aQ3U108 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Arid5aQ3U108 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Arid5aQ3U108 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Arid5aQ3U108 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Arid5aQ3U108 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Arid5aQ3U108 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Arid5aQ3U108 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Arid5aQ3U108 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Arid5aQ3U108 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Arid5aQ3U108 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Arid5aQ3U108 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Arid5aQ3U108 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Arid5aQ3U108 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Arid5aQ3U108 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Arid5aQ3U108 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Arid5aQ3U108 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms