Protein–RNA interactions for Protein: Q3LS21

Kcnk9, Potassium channel subfamily K member 9, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnk9Q3LS21 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Kcnk9Q3LS21 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kcnk9Q3LS21 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Kcnk9Q3LS21 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Kcnk9Q3LS21 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Kcnk9Q3LS21 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Kcnk9Q3LS21 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Kcnk9Q3LS21 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kcnk9Q3LS21 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kcnk9Q3LS21 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kcnk9Q3LS21 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Kcnk9Q3LS21 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Kcnk9Q3LS21 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kcnk9Q3LS21 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Kcnk9Q3LS21 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kcnk9Q3LS21 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kcnk9Q3LS21 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kcnk9Q3LS21 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kcnk9Q3LS21 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kcnk9Q3LS21 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kcnk9Q3LS21 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kcnk9Q3LS21 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Kcnk9Q3LS21 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kcnk9Q3LS21 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kcnk9Q3LS21 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kcnk9Q3LS21 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Kcnk9Q3LS21 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kcnk9Q3LS21 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kcnk9Q3LS21 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kcnk9Q3LS21 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kcnk9Q3LS21 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kcnk9Q3LS21 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kcnk9Q3LS21 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kcnk9Q3LS21 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kcnk9Q3LS21 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kcnk9Q3LS21 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kcnk9Q3LS21 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kcnk9Q3LS21 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kcnk9Q3LS21 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Kcnk9Q3LS21 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kcnk9Q3LS21 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kcnk9Q3LS21 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kcnk9Q3LS21 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kcnk9Q3LS21 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kcnk9Q3LS21 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kcnk9Q3LS21 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kcnk9Q3LS21 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Kcnk9Q3LS21 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Kcnk9Q3LS21 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Kcnk9Q3LS21 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kcnk9Q3LS21 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kcnk9Q3LS21 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kcnk9Q3LS21 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kcnk9Q3LS21 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kcnk9Q3LS21 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kcnk9Q3LS21 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Kcnk9Q3LS21 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kcnk9Q3LS21 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kcnk9Q3LS21 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kcnk9Q3LS21 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kcnk9Q3LS21 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Kcnk9Q3LS21 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kcnk9Q3LS21 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kcnk9Q3LS21 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kcnk9Q3LS21 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kcnk9Q3LS21 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kcnk9Q3LS21 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kcnk9Q3LS21 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kcnk9Q3LS21 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kcnk9Q3LS21 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kcnk9Q3LS21 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Kcnk9Q3LS21 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kcnk9Q3LS21 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kcnk9Q3LS21 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kcnk9Q3LS21 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kcnk9Q3LS21 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kcnk9Q3LS21 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kcnk9Q3LS21 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kcnk9Q3LS21 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kcnk9Q3LS21 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kcnk9Q3LS21 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kcnk9Q3LS21 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kcnk9Q3LS21 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kcnk9Q3LS21 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kcnk9Q3LS21 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kcnk9Q3LS21 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kcnk9Q3LS21 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kcnk9Q3LS21 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Kcnk9Q3LS21 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Kcnk9Q3LS21 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kcnk9Q3LS21 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kcnk9Q3LS21 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kcnk9Q3LS21 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kcnk9Q3LS21 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kcnk9Q3LS21 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kcnk9Q3LS21 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kcnk9Q3LS21 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kcnk9Q3LS21 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kcnk9Q3LS21 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Kcnk9Q3LS21 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.1 ms