Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Kcnma1Q08460 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Kcnma1Q08460 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
Kcnma1Q08460 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29,29■■■□□ 2,28
Kcnma1Q08460 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Kcnma1Q08460 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Kcnma1Q08460 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29,27■■■□□ 2,28
Kcnma1Q08460 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
Kcnma1Q08460 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
Kcnma1Q08460 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
Kcnma1Q08460 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29,23■■■□□ 2,27
Kcnma1Q08460 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29,19■■■□□ 2,26
Kcnma1Q08460 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
Kcnma1Q08460 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29,16■■■□□ 2,26
Kcnma1Q08460 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC29,16■■■□□ 2,26
Kcnma1Q08460 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29,16■■■□□ 2,26
Kcnma1Q08460 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
Kcnma1Q08460 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29,14■■■□□ 2,26
Kcnma1Q08460 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,13■■■□□ 2,25
Kcnma1Q08460 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Kcnma1Q08460 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29,09■■■□□ 2,25
Kcnma1Q08460 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Kcnma1Q08460 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Kcnma1Q08460 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Kcnma1Q08460 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,03■■■□□ 2,24
Kcnma1Q08460 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29,03■■■□□ 2,24
Kcnma1Q08460 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Kcnma1Q08460 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC29,02■■■□□ 2,24
Kcnma1Q08460 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
Kcnma1Q08460 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Kcnma1Q08460 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Kcnma1Q08460 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Kcnma1Q08460 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Kcnma1Q08460 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Kcnma1Q08460 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28,93■■■□□ 2,22
Kcnma1Q08460 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28,93■■■□□ 2,22
Kcnma1Q08460 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
Kcnma1Q08460 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,89■■■□□ 2,22
Kcnma1Q08460 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,21
Kcnma1Q08460 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,21
Kcnma1Q08460 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,21
Kcnma1Q08460 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28,88■■■□□ 2,21
Kcnma1Q08460 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
Kcnma1Q08460 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
Kcnma1Q08460 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28,85■■■□□ 2,21
Kcnma1Q08460 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
Kcnma1Q08460 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
Kcnma1Q08460 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Kcnma1Q08460 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Kcnma1Q08460 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Kcnma1Q08460 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
Kcnma1Q08460 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
Kcnma1Q08460 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
Kcnma1Q08460 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28,78■■■□□ 2,2
Kcnma1Q08460 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28,76■■■□□ 2,19
Kcnma1Q08460 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28,75■■■□□ 2,19
Kcnma1Q08460 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28,72■■■□□ 2,19
Kcnma1Q08460 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
Kcnma1Q08460 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28,71■■■□□ 2,19
Kcnma1Q08460 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,18
Kcnma1Q08460 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,67■■■□□ 2,18
Kcnma1Q08460 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28,67■■■□□ 2,18
Kcnma1Q08460 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
Kcnma1Q08460 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28,65■■■□□ 2,18
Kcnma1Q08460 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,18
Kcnma1Q08460 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
Kcnma1Q08460 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
Kcnma1Q08460 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Kcnma1Q08460 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28,62■■■□□ 2,17
Kcnma1Q08460 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28,61■■■□□ 2,17
Kcnma1Q08460 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Kcnma1Q08460 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,59■■■□□ 2,17
Kcnma1Q08460 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28,58■■■□□ 2,17
Kcnma1Q08460 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28,57■■■□□ 2,16
Kcnma1Q08460 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28,57■■■□□ 2,16
Kcnma1Q08460 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,56■■■□□ 2,16
Kcnma1Q08460 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28,56■■■□□ 2,16
Kcnma1Q08460 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Kcnma1Q08460 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Kcnma1Q08460 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,16
Kcnma1Q08460 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Kcnma1Q08460 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Kcnma1Q08460 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Kcnma1Q08460 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Kcnma1Q08460 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28,49■■■□□ 2,15
Kcnma1Q08460 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Kcnma1Q08460 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Kcnma1Q08460 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Kcnma1Q08460 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,46■■■□□ 2,15
Kcnma1Q08460 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28,46■■■□□ 2,15
Kcnma1Q08460 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28,45■■■□□ 2,15
Kcnma1Q08460 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,45■■■□□ 2,15
Kcnma1Q08460 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,44■■■□□ 2,14
Kcnma1Q08460 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28,43■■■□□ 2,14
Kcnma1Q08460 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Kcnma1Q08460 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Kcnma1Q08460 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,14
Kcnma1Q08460 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,14
Kcnma1Q08460 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28,38■■■□□ 2,13
Kcnma1Q08460 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28,38■■■□□ 2,13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7,7 ms