Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Kcnma1Q08460 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Kcnma1Q08460 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Kcnma1Q08460 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Kcnma1Q08460 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Kcnma1Q08460 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Kcnma1Q08460 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Kcnma1Q08460 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Kcnma1Q08460 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Kcnma1Q08460 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Kcnma1Q08460 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Kcnma1Q08460 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Kcnma1Q08460 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Kcnma1Q08460 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Kcnma1Q08460 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Kcnma1Q08460 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Kcnma1Q08460 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Kcnma1Q08460 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Kcnma1Q08460 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Kcnma1Q08460 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Kcnma1Q08460 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Kcnma1Q08460 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Kcnma1Q08460 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Kcnma1Q08460 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Kcnma1Q08460 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Kcnma1Q08460 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Kcnma1Q08460 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Kcnma1Q08460 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Kcnma1Q08460 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Kcnma1Q08460 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Kcnma1Q08460 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Kcnma1Q08460 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Kcnma1Q08460 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Kcnma1Q08460 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Kcnma1Q08460 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Kcnma1Q08460 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Kcnma1Q08460 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Kcnma1Q08460 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Kcnma1Q08460 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Kcnma1Q08460 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Kcnma1Q08460 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Kcnma1Q08460 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Kcnma1Q08460 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Kcnma1Q08460 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Kcnma1Q08460 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Kcnma1Q08460 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Kcnma1Q08460 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Kcnma1Q08460 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Kcnma1Q08460 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Kcnma1Q08460 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Kcnma1Q08460 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Kcnma1Q08460 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Kcnma1Q08460 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Kcnma1Q08460 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Kcnma1Q08460 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Kcnma1Q08460 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Kcnma1Q08460 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Kcnma1Q08460 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Kcnma1Q08460 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Kcnma1Q08460 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Kcnma1Q08460 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Kcnma1Q08460 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Kcnma1Q08460 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Kcnma1Q08460 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Kcnma1Q08460 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Kcnma1Q08460 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Kcnma1Q08460 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Kcnma1Q08460 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Kcnma1Q08460 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Kcnma1Q08460 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Kcnma1Q08460 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Kcnma1Q08460 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Kcnma1Q08460 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Kcnma1Q08460 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Kcnma1Q08460 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Kcnma1Q08460 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Kcnma1Q08460 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Kcnma1Q08460 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Kcnma1Q08460 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Kcnma1Q08460 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Kcnma1Q08460 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Kcnma1Q08460 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Kcnma1Q08460 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Kcnma1Q08460 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Kcnma1Q08460 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Kcnma1Q08460 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Kcnma1Q08460 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Kcnma1Q08460 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Kcnma1Q08460 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Kcnma1Q08460 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Kcnma1Q08460 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Kcnma1Q08460 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Kcnma1Q08460 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Kcnma1Q08460 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Kcnma1Q08460 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Kcnma1Q08460 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Kcnma1Q08460 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Kcnma1Q08460 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Kcnma1Q08460 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Kcnma1Q08460 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms