Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MestQ07646 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MestQ07646 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MestQ07646 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MestQ07646 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MestQ07646 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MestQ07646 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MestQ07646 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MestQ07646 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MestQ07646 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MestQ07646 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MestQ07646 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MestQ07646 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MestQ07646 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MestQ07646 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MestQ07646 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MestQ07646 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MestQ07646 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MestQ07646 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MestQ07646 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MestQ07646 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MestQ07646 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MestQ07646 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MestQ07646 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MestQ07646 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MestQ07646 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MestQ07646 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MestQ07646 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MestQ07646 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MestQ07646 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MestQ07646 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MestQ07646 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MestQ07646 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MestQ07646 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MestQ07646 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MestQ07646 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MestQ07646 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MestQ07646 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MestQ07646 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MestQ07646 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MestQ07646 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MestQ07646 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MestQ07646 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MestQ07646 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MestQ07646 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MestQ07646 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MestQ07646 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MestQ07646 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MestQ07646 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MestQ07646 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MestQ07646 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MestQ07646 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MestQ07646 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MestQ07646 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MestQ07646 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MestQ07646 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MestQ07646 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MestQ07646 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MestQ07646 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MestQ07646 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MestQ07646 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MestQ07646 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MestQ07646 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MestQ07646 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MestQ07646 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MestQ07646 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MestQ07646 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MestQ07646 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MestQ07646 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MestQ07646 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MestQ07646 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MestQ07646 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
MestQ07646 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MestQ07646 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MestQ07646 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MestQ07646 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MestQ07646 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MestQ07646 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MestQ07646 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MestQ07646 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MestQ07646 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MestQ07646 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MestQ07646 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MestQ07646 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MestQ07646 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MestQ07646 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MestQ07646 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MestQ07646 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MestQ07646 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MestQ07646 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MestQ07646 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MestQ07646 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MestQ07646 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MestQ07646 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MestQ07646 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MestQ07646 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MestQ07646 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MestQ07646 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MestQ07646 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
MestQ07646 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms