Protein–RNA interactions for Protein: Q05A62

Dnal1, Dynein light chain 1, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnal1Q05A62 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dnal1Q05A62 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dnal1Q05A62 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dnal1Q05A62 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dnal1Q05A62 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Dnal1Q05A62 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dnal1Q05A62 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dnal1Q05A62 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dnal1Q05A62 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dnal1Q05A62 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dnal1Q05A62 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dnal1Q05A62 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dnal1Q05A62 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dnal1Q05A62 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Dnal1Q05A62 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Dnal1Q05A62 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Dnal1Q05A62 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Dnal1Q05A62 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dnal1Q05A62 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dnal1Q05A62 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dnal1Q05A62 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dnal1Q05A62 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dnal1Q05A62 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dnal1Q05A62 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dnal1Q05A62 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Dnal1Q05A62 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Dnal1Q05A62 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Dnal1Q05A62 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Dnal1Q05A62 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Dnal1Q05A62 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Dnal1Q05A62 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Dnal1Q05A62 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Dnal1Q05A62 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Dnal1Q05A62 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Dnal1Q05A62 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Dnal1Q05A62 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Dnal1Q05A62 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Dnal1Q05A62 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dnal1Q05A62 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dnal1Q05A62 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dnal1Q05A62 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Dnal1Q05A62 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Dnal1Q05A62 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Dnal1Q05A62 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dnal1Q05A62 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dnal1Q05A62 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dnal1Q05A62 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dnal1Q05A62 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Dnal1Q05A62 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Dnal1Q05A62 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Dnal1Q05A62 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Dnal1Q05A62 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Dnal1Q05A62 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dnal1Q05A62 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Dnal1Q05A62 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Dnal1Q05A62 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Dnal1Q05A62 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Dnal1Q05A62 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Dnal1Q05A62 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Dnal1Q05A62 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Dnal1Q05A62 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Dnal1Q05A62 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Dnal1Q05A62 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Dnal1Q05A62 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Dnal1Q05A62 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Dnal1Q05A62 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Dnal1Q05A62 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Dnal1Q05A62 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Dnal1Q05A62 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Dnal1Q05A62 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Dnal1Q05A62 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Dnal1Q05A62 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dnal1Q05A62 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dnal1Q05A62 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dnal1Q05A62 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dnal1Q05A62 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dnal1Q05A62 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dnal1Q05A62 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Dnal1Q05A62 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Dnal1Q05A62 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dnal1Q05A62 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dnal1Q05A62 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Dnal1Q05A62 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dnal1Q05A62 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dnal1Q05A62 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dnal1Q05A62 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dnal1Q05A62 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Dnal1Q05A62 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dnal1Q05A62 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dnal1Q05A62 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dnal1Q05A62 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dnal1Q05A62 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dnal1Q05A62 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dnal1Q05A62 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Dnal1Q05A62 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dnal1Q05A62 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dnal1Q05A62 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dnal1Q05A62 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Dnal1Q05A62 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dnal1Q05A62 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms