Protein–RNA interactions for Protein: Q04863

Relb, Transcription factor RelB, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelbQ04863 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RelbQ04863 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RelbQ04863 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RelbQ04863 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RelbQ04863 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RelbQ04863 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RelbQ04863 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RelbQ04863 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RelbQ04863 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RelbQ04863 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RelbQ04863 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RelbQ04863 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RelbQ04863 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RelbQ04863 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RelbQ04863 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RelbQ04863 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RelbQ04863 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RelbQ04863 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RelbQ04863 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RelbQ04863 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RelbQ04863 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RelbQ04863 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RelbQ04863 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RelbQ04863 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RelbQ04863 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RelbQ04863 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RelbQ04863 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RelbQ04863 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RelbQ04863 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RelbQ04863 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RelbQ04863 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RelbQ04863 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RelbQ04863 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RelbQ04863 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RelbQ04863 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RelbQ04863 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RelbQ04863 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RelbQ04863 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RelbQ04863 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RelbQ04863 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RelbQ04863 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RelbQ04863 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RelbQ04863 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RelbQ04863 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RelbQ04863 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RelbQ04863 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RelbQ04863 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RelbQ04863 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RelbQ04863 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RelbQ04863 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RelbQ04863 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RelbQ04863 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RelbQ04863 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RelbQ04863 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RelbQ04863 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RelbQ04863 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RelbQ04863 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RelbQ04863 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RelbQ04863 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RelbQ04863 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RelbQ04863 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RelbQ04863 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RelbQ04863 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RelbQ04863 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RelbQ04863 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RelbQ04863 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RelbQ04863 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RelbQ04863 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RelbQ04863 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RelbQ04863 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RelbQ04863 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RelbQ04863 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RelbQ04863 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RelbQ04863 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RelbQ04863 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RelbQ04863 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RelbQ04863 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RelbQ04863 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RelbQ04863 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RelbQ04863 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RelbQ04863 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RelbQ04863 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RelbQ04863 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RelbQ04863 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RelbQ04863 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RelbQ04863 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RelbQ04863 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RelbQ04863 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RelbQ04863 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RelbQ04863 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RelbQ04863 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RelbQ04863 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RelbQ04863 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RelbQ04863 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RelbQ04863 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RelbQ04863 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RelbQ04863 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RelbQ04863 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RelbQ04863 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RelbQ04863 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms