Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GscQ02591 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GscQ02591 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GscQ02591 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GscQ02591 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GscQ02591 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GscQ02591 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GscQ02591 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
GscQ02591 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GscQ02591 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GscQ02591 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GscQ02591 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GscQ02591 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GscQ02591 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GscQ02591 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GscQ02591 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
GscQ02591 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GscQ02591 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GscQ02591 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GscQ02591 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
GscQ02591 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GscQ02591 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GscQ02591 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GscQ02591 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
GscQ02591 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GscQ02591 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GscQ02591 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
GscQ02591 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
GscQ02591 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GscQ02591 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GscQ02591 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GscQ02591 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
GscQ02591 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
GscQ02591 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GscQ02591 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GscQ02591 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
GscQ02591 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
GscQ02591 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
GscQ02591 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
GscQ02591 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GscQ02591 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GscQ02591 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GscQ02591 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GscQ02591 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GscQ02591 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GscQ02591 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GscQ02591 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GscQ02591 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GscQ02591 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GscQ02591 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GscQ02591 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GscQ02591 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GscQ02591 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GscQ02591 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GscQ02591 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GscQ02591 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GscQ02591 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GscQ02591 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GscQ02591 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GscQ02591 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GscQ02591 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GscQ02591 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GscQ02591 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GscQ02591 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GscQ02591 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GscQ02591 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GscQ02591 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GscQ02591 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GscQ02591 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GscQ02591 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GscQ02591 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GscQ02591 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GscQ02591 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GscQ02591 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GscQ02591 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GscQ02591 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GscQ02591 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GscQ02591 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GscQ02591 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
GscQ02591 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GscQ02591 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GscQ02591 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GscQ02591 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GscQ02591 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GscQ02591 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GscQ02591 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GscQ02591 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GscQ02591 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GscQ02591 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GscQ02591 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GscQ02591 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GscQ02591 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GscQ02591 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GscQ02591 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GscQ02591 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GscQ02591 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GscQ02591 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
GscQ02591 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GscQ02591 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GscQ02591 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms