Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pde1bQ01065 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pde1bQ01065 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Pde1bQ01065 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pde1bQ01065 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pde1bQ01065 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pde1bQ01065 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Pde1bQ01065 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Pde1bQ01065 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pde1bQ01065 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Pde1bQ01065 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Pde1bQ01065 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Pde1bQ01065 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Pde1bQ01065 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pde1bQ01065 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pde1bQ01065 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pde1bQ01065 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Pde1bQ01065 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pde1bQ01065 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pde1bQ01065 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Pde1bQ01065 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Pde1bQ01065 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pde1bQ01065 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pde1bQ01065 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pde1bQ01065 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pde1bQ01065 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pde1bQ01065 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Pde1bQ01065 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pde1bQ01065 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pde1bQ01065 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Pde1bQ01065 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pde1bQ01065 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pde1bQ01065 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pde1bQ01065 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pde1bQ01065 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pde1bQ01065 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pde1bQ01065 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pde1bQ01065 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pde1bQ01065 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pde1bQ01065 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pde1bQ01065 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pde1bQ01065 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pde1bQ01065 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pde1bQ01065 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pde1bQ01065 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pde1bQ01065 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pde1bQ01065 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pde1bQ01065 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pde1bQ01065 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pde1bQ01065 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pde1bQ01065 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pde1bQ01065 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pde1bQ01065 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pde1bQ01065 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pde1bQ01065 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pde1bQ01065 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pde1bQ01065 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Pde1bQ01065 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pde1bQ01065 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pde1bQ01065 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pde1bQ01065 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pde1bQ01065 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pde1bQ01065 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pde1bQ01065 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pde1bQ01065 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pde1bQ01065 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Pde1bQ01065 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pde1bQ01065 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pde1bQ01065 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pde1bQ01065 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pde1bQ01065 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pde1bQ01065 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pde1bQ01065 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pde1bQ01065 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Pde1bQ01065 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pde1bQ01065 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pde1bQ01065 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pde1bQ01065 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pde1bQ01065 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pde1bQ01065 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pde1bQ01065 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pde1bQ01065 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pde1bQ01065 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pde1bQ01065 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pde1bQ01065 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Pde1bQ01065 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pde1bQ01065 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pde1bQ01065 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pde1bQ01065 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Pde1bQ01065 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pde1bQ01065 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pde1bQ01065 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Pde1bQ01065 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pde1bQ01065 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pde1bQ01065 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pde1bQ01065 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Pde1bQ01065 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pde1bQ01065 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pde1bQ01065 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pde1bQ01065 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms