Protein–RNA interactions for Protein: P98191

Cds1, Phosphatidate cytidylyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cds1P98191 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cds1P98191 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cds1P98191 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Cds1P98191 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cds1P98191 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Cds1P98191 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cds1P98191 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cds1P98191 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cds1P98191 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cds1P98191 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cds1P98191 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cds1P98191 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cds1P98191 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cds1P98191 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cds1P98191 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cds1P98191 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Cds1P98191 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cds1P98191 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cds1P98191 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cds1P98191 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cds1P98191 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Cds1P98191 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cds1P98191 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cds1P98191 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cds1P98191 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cds1P98191 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cds1P98191 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cds1P98191 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cds1P98191 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cds1P98191 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cds1P98191 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Cds1P98191 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cds1P98191 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cds1P98191 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Cds1P98191 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Cds1P98191 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cds1P98191 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cds1P98191 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cds1P98191 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cds1P98191 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cds1P98191 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cds1P98191 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cds1P98191 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cds1P98191 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cds1P98191 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cds1P98191 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cds1P98191 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cds1P98191 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cds1P98191 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cds1P98191 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cds1P98191 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cds1P98191 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cds1P98191 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cds1P98191 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cds1P98191 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cds1P98191 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cds1P98191 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cds1P98191 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cds1P98191 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cds1P98191 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cds1P98191 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cds1P98191 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cds1P98191 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cds1P98191 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cds1P98191 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cds1P98191 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cds1P98191 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cds1P98191 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cds1P98191 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cds1P98191 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cds1P98191 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cds1P98191 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cds1P98191 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cds1P98191 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cds1P98191 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cds1P98191 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cds1P98191 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cds1P98191 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cds1P98191 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cds1P98191 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Cds1P98191 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cds1P98191 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Cds1P98191 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cds1P98191 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cds1P98191 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Cds1P98191 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cds1P98191 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cds1P98191 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cds1P98191 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cds1P98191 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cds1P98191 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cds1P98191 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cds1P98191 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cds1P98191 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cds1P98191 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cds1P98191 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cds1P98191 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cds1P98191 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cds1P98191 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cds1P98191 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.4 ms