Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ptprn2P80560 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ptprn2P80560 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ptprn2P80560 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ptprn2P80560 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ptprn2P80560 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Ptprn2P80560 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ptprn2P80560 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Ptprn2P80560 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ptprn2P80560 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ptprn2P80560 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ptprn2P80560 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ptprn2P80560 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ptprn2P80560 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Ptprn2P80560 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ptprn2P80560 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ptprn2P80560 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ptprn2P80560 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ptprn2P80560 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ptprn2P80560 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ptprn2P80560 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ptprn2P80560 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ptprn2P80560 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ptprn2P80560 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ptprn2P80560 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ptprn2P80560 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ptprn2P80560 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ptprn2P80560 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ptprn2P80560 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ptprn2P80560 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Ptprn2P80560 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Ptprn2P80560 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ptprn2P80560 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Ptprn2P80560 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ptprn2P80560 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ptprn2P80560 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ptprn2P80560 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ptprn2P80560 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ptprn2P80560 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Ptprn2P80560 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ptprn2P80560 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Ptprn2P80560 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ptprn2P80560 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ptprn2P80560 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ptprn2P80560 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Ptprn2P80560 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ptprn2P80560 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Ptprn2P80560 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ptprn2P80560 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ptprn2P80560 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ptprn2P80560 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ptprn2P80560 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ptprn2P80560 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ptprn2P80560 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ptprn2P80560 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ptprn2P80560 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ptprn2P80560 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ptprn2P80560 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Ptprn2P80560 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ptprn2P80560 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ptprn2P80560 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ptprn2P80560 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ptprn2P80560 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ptprn2P80560 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ptprn2P80560 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ptprn2P80560 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ptprn2P80560 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ptprn2P80560 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ptprn2P80560 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ptprn2P80560 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ptprn2P80560 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ptprn2P80560 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ptprn2P80560 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ptprn2P80560 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ptprn2P80560 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ptprn2P80560 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ptprn2P80560 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ptprn2P80560 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ptprn2P80560 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ptprn2P80560 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ptprn2P80560 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ptprn2P80560 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ptprn2P80560 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ptprn2P80560 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ptprn2P80560 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ptprn2P80560 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ptprn2P80560 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ptprn2P80560 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ptprn2P80560 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ptprn2P80560 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ptprn2P80560 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ptprn2P80560 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ptprn2P80560 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ptprn2P80560 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ptprn2P80560 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ptprn2P80560 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ptprn2P80560 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ptprn2P80560 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ptprn2P80560 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ptprn2P80560 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms