Protein–RNA interactions for Protein: P80313

Cct7, T-complex protein 1 subunit eta, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct7P80313 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cct7P80313 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cct7P80313 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cct7P80313 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cct7P80313 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cct7P80313 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cct7P80313 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cct7P80313 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Cct7P80313 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cct7P80313 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cct7P80313 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cct7P80313 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Cct7P80313 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cct7P80313 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cct7P80313 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Cct7P80313 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Cct7P80313 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Cct7P80313 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cct7P80313 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cct7P80313 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cct7P80313 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cct7P80313 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cct7P80313 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cct7P80313 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cct7P80313 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cct7P80313 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cct7P80313 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cct7P80313 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cct7P80313 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cct7P80313 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cct7P80313 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cct7P80313 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cct7P80313 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cct7P80313 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cct7P80313 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cct7P80313 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cct7P80313 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cct7P80313 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cct7P80313 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cct7P80313 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cct7P80313 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Cct7P80313 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cct7P80313 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cct7P80313 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cct7P80313 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cct7P80313 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cct7P80313 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cct7P80313 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cct7P80313 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cct7P80313 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cct7P80313 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cct7P80313 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cct7P80313 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cct7P80313 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cct7P80313 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cct7P80313 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cct7P80313 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cct7P80313 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cct7P80313 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cct7P80313 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cct7P80313 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cct7P80313 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cct7P80313 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cct7P80313 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cct7P80313 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cct7P80313 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Cct7P80313 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cct7P80313 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cct7P80313 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cct7P80313 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cct7P80313 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cct7P80313 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cct7P80313 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cct7P80313 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cct7P80313 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cct7P80313 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cct7P80313 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cct7P80313 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cct7P80313 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Cct7P80313 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cct7P80313 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Cct7P80313 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cct7P80313 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cct7P80313 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cct7P80313 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cct7P80313 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Cct7P80313 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cct7P80313 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cct7P80313 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cct7P80313 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cct7P80313 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cct7P80313 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Cct7P80313 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cct7P80313 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cct7P80313 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cct7P80313 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cct7P80313 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cct7P80313 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cct7P80313 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cct7P80313 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms