Protein–RNA interactions for Protein: P79568

H2-Q6, Class Ib MHC antigen Qa-2, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q6P79568 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
H2-Q6P79568 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
H2-Q6P79568 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
H2-Q6P79568 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
H2-Q6P79568 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
H2-Q6P79568 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
H2-Q6P79568 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
H2-Q6P79568 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
H2-Q6P79568 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
H2-Q6P79568 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
H2-Q6P79568 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
H2-Q6P79568 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
H2-Q6P79568 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
H2-Q6P79568 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
H2-Q6P79568 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
H2-Q6P79568 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
H2-Q6P79568 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
H2-Q6P79568 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
H2-Q6P79568 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
H2-Q6P79568 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
H2-Q6P79568 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
H2-Q6P79568 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
H2-Q6P79568 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
H2-Q6P79568 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
H2-Q6P79568 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
H2-Q6P79568 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
H2-Q6P79568 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
H2-Q6P79568 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
H2-Q6P79568 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
H2-Q6P79568 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
H2-Q6P79568 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
H2-Q6P79568 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
H2-Q6P79568 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
H2-Q6P79568 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
H2-Q6P79568 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
H2-Q6P79568 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
H2-Q6P79568 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
H2-Q6P79568 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
H2-Q6P79568 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
H2-Q6P79568 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
H2-Q6P79568 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
H2-Q6P79568 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
H2-Q6P79568 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
H2-Q6P79568 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
H2-Q6P79568 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
H2-Q6P79568 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
H2-Q6P79568 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
H2-Q6P79568 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
H2-Q6P79568 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
H2-Q6P79568 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
H2-Q6P79568 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
H2-Q6P79568 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
H2-Q6P79568 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
H2-Q6P79568 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
H2-Q6P79568 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
H2-Q6P79568 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
H2-Q6P79568 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
H2-Q6P79568 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
H2-Q6P79568 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
H2-Q6P79568 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
H2-Q6P79568 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
H2-Q6P79568 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
H2-Q6P79568 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
H2-Q6P79568 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
H2-Q6P79568 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
H2-Q6P79568 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
H2-Q6P79568 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
H2-Q6P79568 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
H2-Q6P79568 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
H2-Q6P79568 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
H2-Q6P79568 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
H2-Q6P79568 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
H2-Q6P79568 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
H2-Q6P79568 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
H2-Q6P79568 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
H2-Q6P79568 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
H2-Q6P79568 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
H2-Q6P79568 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
H2-Q6P79568 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
H2-Q6P79568 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
H2-Q6P79568 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
H2-Q6P79568 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
H2-Q6P79568 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
H2-Q6P79568 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
H2-Q6P79568 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
H2-Q6P79568 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
H2-Q6P79568 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
H2-Q6P79568 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
H2-Q6P79568 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
H2-Q6P79568 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
H2-Q6P79568 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
H2-Q6P79568 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
H2-Q6P79568 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
H2-Q6P79568 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
H2-Q6P79568 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
H2-Q6P79568 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
H2-Q6P79568 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
H2-Q6P79568 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
H2-Q6P79568 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
H2-Q6P79568 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms