Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,09■■□□□ 1,61
Gfi1P70338 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25,07■■□□□ 1,6
Gfi1P70338 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25,07■■□□□ 1,6
Gfi1P70338 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25,06■■□□□ 1,6
Gfi1P70338 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25,06■■□□□ 1,6
Gfi1P70338 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,05■■□□□ 1,6
Gfi1P70338 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,01■■□□□ 1,59
Gfi1P70338 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Gfi1P70338 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24,99■■□□□ 1,59
Gfi1P70338 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
Gfi1P70338 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24,96■■□□□ 1,59
Gfi1P70338 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24,95■■□□□ 1,58
Gfi1P70338 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
Gfi1P70338 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24,92■■□□□ 1,58
Gfi1P70338 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
Gfi1P70338 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
Gfi1P70338 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24,9■■□□□ 1,58
Gfi1P70338 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
Gfi1P70338 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
Gfi1P70338 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
Gfi1P70338 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24,86■■□□□ 1,57
Gfi1P70338 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
Gfi1P70338 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
Gfi1P70338 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
Gfi1P70338 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,81■■□□□ 1,56
Gfi1P70338 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
Gfi1P70338 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24,81■■□□□ 1,56
Gfi1P70338 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,8■■□□□ 1,56
Gfi1P70338 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,8■■□□□ 1,56
Gfi1P70338 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,78■■□□□ 1,56
Gfi1P70338 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24,78■■□□□ 1,56
Gfi1P70338 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
Gfi1P70338 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24,76■■□□□ 1,55
Gfi1P70338 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
Gfi1P70338 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24,75■■□□□ 1,55
Gfi1P70338 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,74■■□□□ 1,55
Gfi1P70338 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,72■■□□□ 1,55
Gfi1P70338 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,71■■□□□ 1,55
Gfi1P70338 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,71■■□□□ 1,55
Gfi1P70338 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,71■■□□□ 1,55
Gfi1P70338 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,71■■□□□ 1,55
Gfi1P70338 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,71■■□□□ 1,55
Gfi1P70338 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24,7■■□□□ 1,55
Gfi1P70338 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,7■■□□□ 1,55
Gfi1P70338 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,68■■□□□ 1,54
Gfi1P70338 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,68■■□□□ 1,54
Gfi1P70338 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,67■■□□□ 1,54
Gfi1P70338 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24,67■■□□□ 1,54
Gfi1P70338 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,67■■□□□ 1,54
Gfi1P70338 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24,66■■□□□ 1,54
Gfi1P70338 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24,65■■□□□ 1,54
Gfi1P70338 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,62■■□□□ 1,53
Gfi1P70338 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24,6■■□□□ 1,53
Gfi1P70338 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,59■■□□□ 1,53
Gfi1P70338 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24,59■■□□□ 1,53
Gfi1P70338 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
Gfi1P70338 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
Gfi1P70338 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
Gfi1P70338 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,55■■□□□ 1,52
Gfi1P70338 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,54■■□□□ 1,52
Gfi1P70338 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,53■■□□□ 1,52
Gfi1P70338 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,53■■□□□ 1,52
Gfi1P70338 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,52■■□□□ 1,52
Gfi1P70338 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,52■■□□□ 1,52
Gfi1P70338 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,52■■□□□ 1,52
Gfi1P70338 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,51■■□□□ 1,51
Gfi1P70338 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,51■■□□□ 1,51
Gfi1P70338 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24,5■■□□□ 1,51
Gfi1P70338 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,5■■□□□ 1,51
Gfi1P70338 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,5■■□□□ 1,51
Gfi1P70338 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,49■■□□□ 1,51
Gfi1P70338 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,49■■□□□ 1,51
Gfi1P70338 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24,48■■□□□ 1,51
Gfi1P70338 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24,48■■□□□ 1,51
Gfi1P70338 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24,48■■□□□ 1,51
Gfi1P70338 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
Gfi1P70338 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24,45■■□□□ 1,51
Gfi1P70338 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24,44■■□□□ 1,5
Gfi1P70338 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24,43■■□□□ 1,5
Gfi1P70338 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,43■■□□□ 1,5
Gfi1P70338 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24,43■■□□□ 1,5
Gfi1P70338 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,43■■□□□ 1,5
Gfi1P70338 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24,41■■□□□ 1,5
Gfi1P70338 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,4■■□□□ 1,5
Gfi1P70338 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24,4■■□□□ 1,5
Gfi1P70338 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24,4■■□□□ 1,5
Gfi1P70338 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,4■■□□□ 1,5
Gfi1P70338 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,39■■□□□ 1,5
Gfi1P70338 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24,38■■□□□ 1,49
Gfi1P70338 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24,36■■□□□ 1,49
Gfi1P70338 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24,35■■□□□ 1,49
Gfi1P70338 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24,35■■□□□ 1,49
Gfi1P70338 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,35■■□□□ 1,49
Gfi1P70338 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24,35■■□□□ 1,49
Gfi1P70338 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24,34■■□□□ 1,49
Gfi1P70338 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24,33■■□□□ 1,49
Gfi1P70338 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,33■■□□□ 1,49
Gfi1P70338 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24,32■■□□□ 1,48
Gfi1P70338 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,29■■□□□ 1,48
Gfi1P70338 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,29■■□□□ 1,48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65,8 ms