Protein–RNA interactions for Protein: P62956

Cacng7, Voltage-dependent calcium channel gamma-7 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng7P62956 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cacng7P62956 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cacng7P62956 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cacng7P62956 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cacng7P62956 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cacng7P62956 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cacng7P62956 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cacng7P62956 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cacng7P62956 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cacng7P62956 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cacng7P62956 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cacng7P62956 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cacng7P62956 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cacng7P62956 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cacng7P62956 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Cacng7P62956 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cacng7P62956 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cacng7P62956 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cacng7P62956 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cacng7P62956 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cacng7P62956 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cacng7P62956 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cacng7P62956 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cacng7P62956 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cacng7P62956 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cacng7P62956 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cacng7P62956 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cacng7P62956 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cacng7P62956 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Cacng7P62956 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cacng7P62956 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cacng7P62956 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cacng7P62956 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cacng7P62956 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Cacng7P62956 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cacng7P62956 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cacng7P62956 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cacng7P62956 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cacng7P62956 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cacng7P62956 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cacng7P62956 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cacng7P62956 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cacng7P62956 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cacng7P62956 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cacng7P62956 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cacng7P62956 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cacng7P62956 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cacng7P62956 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cacng7P62956 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cacng7P62956 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cacng7P62956 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cacng7P62956 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cacng7P62956 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cacng7P62956 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cacng7P62956 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cacng7P62956 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cacng7P62956 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cacng7P62956 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cacng7P62956 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cacng7P62956 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cacng7P62956 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cacng7P62956 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cacng7P62956 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Cacng7P62956 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cacng7P62956 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cacng7P62956 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cacng7P62956 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cacng7P62956 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cacng7P62956 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cacng7P62956 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cacng7P62956 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cacng7P62956 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cacng7P62956 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cacng7P62956 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cacng7P62956 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cacng7P62956 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cacng7P62956 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cacng7P62956 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cacng7P62956 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cacng7P62956 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cacng7P62956 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cacng7P62956 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cacng7P62956 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cacng7P62956 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cacng7P62956 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Cacng7P62956 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cacng7P62956 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cacng7P62956 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Cacng7P62956 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cacng7P62956 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cacng7P62956 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cacng7P62956 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cacng7P62956 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cacng7P62956 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cacng7P62956 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cacng7P62956 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cacng7P62956 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cacng7P62956 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cacng7P62956 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cacng7P62956 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms