Protein–RNA interactions for Protein: P62748

Hpcal1, Hippocalcin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpcal1P62748 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hpcal1P62748 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hpcal1P62748 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hpcal1P62748 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hpcal1P62748 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hpcal1P62748 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hpcal1P62748 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hpcal1P62748 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hpcal1P62748 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Hpcal1P62748 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hpcal1P62748 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hpcal1P62748 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hpcal1P62748 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Hpcal1P62748 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hpcal1P62748 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Hpcal1P62748 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hpcal1P62748 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hpcal1P62748 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Hpcal1P62748 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hpcal1P62748 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hpcal1P62748 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hpcal1P62748 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hpcal1P62748 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Hpcal1P62748 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Hpcal1P62748 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hpcal1P62748 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hpcal1P62748 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hpcal1P62748 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hpcal1P62748 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Hpcal1P62748 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hpcal1P62748 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hpcal1P62748 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hpcal1P62748 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hpcal1P62748 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hpcal1P62748 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Hpcal1P62748 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hpcal1P62748 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hpcal1P62748 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hpcal1P62748 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hpcal1P62748 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Hpcal1P62748 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hpcal1P62748 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hpcal1P62748 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hpcal1P62748 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hpcal1P62748 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hpcal1P62748 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hpcal1P62748 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hpcal1P62748 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hpcal1P62748 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hpcal1P62748 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hpcal1P62748 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hpcal1P62748 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hpcal1P62748 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hpcal1P62748 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hpcal1P62748 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hpcal1P62748 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hpcal1P62748 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hpcal1P62748 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hpcal1P62748 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hpcal1P62748 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hpcal1P62748 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hpcal1P62748 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hpcal1P62748 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hpcal1P62748 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hpcal1P62748 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hpcal1P62748 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hpcal1P62748 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hpcal1P62748 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hpcal1P62748 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hpcal1P62748 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hpcal1P62748 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Hpcal1P62748 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hpcal1P62748 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hpcal1P62748 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hpcal1P62748 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hpcal1P62748 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hpcal1P62748 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hpcal1P62748 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Hpcal1P62748 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hpcal1P62748 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hpcal1P62748 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hpcal1P62748 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hpcal1P62748 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hpcal1P62748 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hpcal1P62748 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hpcal1P62748 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hpcal1P62748 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hpcal1P62748 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Hpcal1P62748 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hpcal1P62748 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hpcal1P62748 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hpcal1P62748 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hpcal1P62748 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hpcal1P62748 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hpcal1P62748 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hpcal1P62748 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hpcal1P62748 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hpcal1P62748 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hpcal1P62748 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hpcal1P62748 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms