Protein–RNA interactions for Protein: P62746

Rhob, Rho-related GTP-binding protein RhoB, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhobP62746 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RhobP62746 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RhobP62746 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RhobP62746 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RhobP62746 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RhobP62746 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RhobP62746 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RhobP62746 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RhobP62746 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RhobP62746 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RhobP62746 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RhobP62746 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RhobP62746 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RhobP62746 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
RhobP62746 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RhobP62746 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RhobP62746 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RhobP62746 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RhobP62746 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RhobP62746 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RhobP62746 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RhobP62746 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RhobP62746 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RhobP62746 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RhobP62746 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RhobP62746 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RhobP62746 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RhobP62746 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RhobP62746 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RhobP62746 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RhobP62746 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RhobP62746 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RhobP62746 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RhobP62746 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RhobP62746 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RhobP62746 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RhobP62746 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RhobP62746 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RhobP62746 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RhobP62746 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RhobP62746 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RhobP62746 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RhobP62746 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RhobP62746 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RhobP62746 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RhobP62746 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RhobP62746 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RhobP62746 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RhobP62746 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RhobP62746 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RhobP62746 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RhobP62746 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RhobP62746 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RhobP62746 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RhobP62746 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RhobP62746 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RhobP62746 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RhobP62746 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RhobP62746 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RhobP62746 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RhobP62746 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RhobP62746 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RhobP62746 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RhobP62746 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RhobP62746 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RhobP62746 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RhobP62746 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RhobP62746 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RhobP62746 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RhobP62746 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RhobP62746 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RhobP62746 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RhobP62746 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RhobP62746 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RhobP62746 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RhobP62746 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RhobP62746 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RhobP62746 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RhobP62746 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RhobP62746 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RhobP62746 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RhobP62746 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RhobP62746 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RhobP62746 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RhobP62746 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RhobP62746 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RhobP62746 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RhobP62746 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RhobP62746 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RhobP62746 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RhobP62746 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RhobP62746 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RhobP62746 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RhobP62746 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RhobP62746 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RhobP62746 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RhobP62746 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RhobP62746 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RhobP62746 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RhobP62746 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms