Protein–RNA interactions for Protein: P62717

Rpl18a, 60S ribosomal protein L18a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl18aP62717 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl18aP62717 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl18aP62717 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl18aP62717 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl18aP62717 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl18aP62717 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl18aP62717 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl18aP62717 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl18aP62717 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl18aP62717 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rpl18aP62717 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpl18aP62717 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl18aP62717 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl18aP62717 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl18aP62717 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl18aP62717 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl18aP62717 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpl18aP62717 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpl18aP62717 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpl18aP62717 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpl18aP62717 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpl18aP62717 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl18aP62717 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl18aP62717 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl18aP62717 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl18aP62717 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl18aP62717 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl18aP62717 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl18aP62717 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl18aP62717 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl18aP62717 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl18aP62717 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl18aP62717 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpl18aP62717 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpl18aP62717 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpl18aP62717 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rpl18aP62717 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rpl18aP62717 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rpl18aP62717 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpl18aP62717 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpl18aP62717 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpl18aP62717 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpl18aP62717 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpl18aP62717 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpl18aP62717 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpl18aP62717 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpl18aP62717 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpl18aP62717 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpl18aP62717 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpl18aP62717 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpl18aP62717 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpl18aP62717 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpl18aP62717 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpl18aP62717 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpl18aP62717 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpl18aP62717 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpl18aP62717 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpl18aP62717 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpl18aP62717 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl18aP62717 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl18aP62717 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl18aP62717 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl18aP62717 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl18aP62717 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rpl18aP62717 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpl18aP62717 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl18aP62717 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl18aP62717 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl18aP62717 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl18aP62717 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl18aP62717 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl18aP62717 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl18aP62717 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpl18aP62717 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpl18aP62717 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl18aP62717 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl18aP62717 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl18aP62717 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl18aP62717 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl18aP62717 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl18aP62717 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl18aP62717 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl18aP62717 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl18aP62717 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl18aP62717 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl18aP62717 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl18aP62717 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl18aP62717 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl18aP62717 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl18aP62717 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl18aP62717 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl18aP62717 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl18aP62717 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl18aP62717 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl18aP62717 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl18aP62717 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl18aP62717 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl18aP62717 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl18aP62717 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl18aP62717 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms