Protein–RNA interactions for Protein: P62334

Psmc6, 26S proteasome regulatory subunit 10B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmc6P62334 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Psmc6P62334 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
Psmc6P62334 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Psmc6P62334 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Psmc6P62334 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Psmc6P62334 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Psmc6P62334 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Psmc6P62334 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Psmc6P62334 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Psmc6P62334 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Psmc6P62334 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Psmc6P62334 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Psmc6P62334 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Psmc6P62334 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Psmc6P62334 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Psmc6P62334 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Psmc6P62334 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Psmc6P62334 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Psmc6P62334 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Psmc6P62334 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Psmc6P62334 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Psmc6P62334 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Psmc6P62334 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Psmc6P62334 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Psmc6P62334 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Psmc6P62334 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Psmc6P62334 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Psmc6P62334 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Psmc6P62334 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Psmc6P62334 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Psmc6P62334 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Psmc6P62334 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Psmc6P62334 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Psmc6P62334 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Psmc6P62334 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Psmc6P62334 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Psmc6P62334 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Psmc6P62334 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Psmc6P62334 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Psmc6P62334 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Psmc6P62334 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Psmc6P62334 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Psmc6P62334 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Psmc6P62334 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Psmc6P62334 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Psmc6P62334 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Psmc6P62334 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Psmc6P62334 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Psmc6P62334 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Psmc6P62334 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Psmc6P62334 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Psmc6P62334 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Psmc6P62334 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Psmc6P62334 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Psmc6P62334 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Psmc6P62334 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Psmc6P62334 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Psmc6P62334 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Psmc6P62334 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Psmc6P62334 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Psmc6P62334 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Psmc6P62334 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Psmc6P62334 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Psmc6P62334 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Psmc6P62334 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Psmc6P62334 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Psmc6P62334 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Psmc6P62334 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Psmc6P62334 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Psmc6P62334 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Psmc6P62334 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Psmc6P62334 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Psmc6P62334 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Psmc6P62334 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Psmc6P62334 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Psmc6P62334 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Psmc6P62334 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Psmc6P62334 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Psmc6P62334 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Psmc6P62334 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Psmc6P62334 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Psmc6P62334 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Psmc6P62334 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Psmc6P62334 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Psmc6P62334 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Psmc6P62334 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Psmc6P62334 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Psmc6P62334 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Psmc6P62334 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Psmc6P62334 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Psmc6P62334 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Psmc6P62334 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Psmc6P62334 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Psmc6P62334 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Psmc6P62334 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Psmc6P62334 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
Psmc6P62334 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Psmc6P62334 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Psmc6P62334 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Psmc6P62334 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms