Protein–RNA interactions for Protein: P62305

Snrpe, Small nuclear ribonucleoprotein E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpeP62305 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SnrpeP62305 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SnrpeP62305 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SnrpeP62305 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SnrpeP62305 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SnrpeP62305 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SnrpeP62305 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SnrpeP62305 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SnrpeP62305 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SnrpeP62305 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SnrpeP62305 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SnrpeP62305 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SnrpeP62305 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SnrpeP62305 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SnrpeP62305 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SnrpeP62305 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SnrpeP62305 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SnrpeP62305 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SnrpeP62305 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SnrpeP62305 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SnrpeP62305 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SnrpeP62305 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SnrpeP62305 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SnrpeP62305 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SnrpeP62305 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SnrpeP62305 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SnrpeP62305 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SnrpeP62305 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SnrpeP62305 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SnrpeP62305 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SnrpeP62305 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SnrpeP62305 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SnrpeP62305 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SnrpeP62305 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SnrpeP62305 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SnrpeP62305 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SnrpeP62305 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SnrpeP62305 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SnrpeP62305 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SnrpeP62305 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SnrpeP62305 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SnrpeP62305 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SnrpeP62305 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SnrpeP62305 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SnrpeP62305 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SnrpeP62305 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SnrpeP62305 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SnrpeP62305 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SnrpeP62305 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SnrpeP62305 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SnrpeP62305 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SnrpeP62305 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SnrpeP62305 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SnrpeP62305 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SnrpeP62305 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SnrpeP62305 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SnrpeP62305 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SnrpeP62305 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SnrpeP62305 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SnrpeP62305 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SnrpeP62305 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SnrpeP62305 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SnrpeP62305 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SnrpeP62305 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SnrpeP62305 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SnrpeP62305 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SnrpeP62305 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SnrpeP62305 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SnrpeP62305 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SnrpeP62305 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SnrpeP62305 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SnrpeP62305 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SnrpeP62305 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SnrpeP62305 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SnrpeP62305 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SnrpeP62305 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SnrpeP62305 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SnrpeP62305 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SnrpeP62305 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SnrpeP62305 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SnrpeP62305 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SnrpeP62305 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SnrpeP62305 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SnrpeP62305 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SnrpeP62305 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SnrpeP62305 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SnrpeP62305 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SnrpeP62305 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SnrpeP62305 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SnrpeP62305 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SnrpeP62305 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SnrpeP62305 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SnrpeP62305 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SnrpeP62305 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SnrpeP62305 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SnrpeP62305 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SnrpeP62305 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SnrpeP62305 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SnrpeP62305 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SnrpeP62305 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms