Protein–RNA interactions for Protein: P61809

Cdk5r1, Cyclin-dependent kinase 5 activator 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5r1P61809 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdk5r1P61809 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdk5r1P61809 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdk5r1P61809 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdk5r1P61809 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdk5r1P61809 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cdk5r1P61809 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdk5r1P61809 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdk5r1P61809 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdk5r1P61809 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdk5r1P61809 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdk5r1P61809 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdk5r1P61809 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdk5r1P61809 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cdk5r1P61809 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdk5r1P61809 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdk5r1P61809 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdk5r1P61809 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdk5r1P61809 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdk5r1P61809 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdk5r1P61809 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdk5r1P61809 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdk5r1P61809 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdk5r1P61809 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdk5r1P61809 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdk5r1P61809 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdk5r1P61809 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdk5r1P61809 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdk5r1P61809 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdk5r1P61809 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdk5r1P61809 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdk5r1P61809 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdk5r1P61809 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdk5r1P61809 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdk5r1P61809 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdk5r1P61809 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdk5r1P61809 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdk5r1P61809 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdk5r1P61809 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdk5r1P61809 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdk5r1P61809 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdk5r1P61809 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdk5r1P61809 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdk5r1P61809 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdk5r1P61809 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdk5r1P61809 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdk5r1P61809 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdk5r1P61809 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdk5r1P61809 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdk5r1P61809 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdk5r1P61809 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdk5r1P61809 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdk5r1P61809 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdk5r1P61809 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdk5r1P61809 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdk5r1P61809 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdk5r1P61809 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdk5r1P61809 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdk5r1P61809 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdk5r1P61809 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cdk5r1P61809 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cdk5r1P61809 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cdk5r1P61809 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdk5r1P61809 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdk5r1P61809 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdk5r1P61809 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdk5r1P61809 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdk5r1P61809 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdk5r1P61809 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdk5r1P61809 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdk5r1P61809 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdk5r1P61809 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cdk5r1P61809 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cdk5r1P61809 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdk5r1P61809 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdk5r1P61809 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdk5r1P61809 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdk5r1P61809 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdk5r1P61809 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdk5r1P61809 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdk5r1P61809 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdk5r1P61809 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdk5r1P61809 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk5r1P61809 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdk5r1P61809 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdk5r1P61809 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk5r1P61809 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdk5r1P61809 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdk5r1P61809 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdk5r1P61809 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk5r1P61809 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk5r1P61809 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk5r1P61809 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk5r1P61809 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk5r1P61809 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk5r1P61809 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk5r1P61809 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdk5r1P61809 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdk5r1P61809 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdk5r1P61809 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms