Protein–RNA interactions for Protein: P59672

Anks1a, Ankyrin repeat and SAM domain-containing protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Anks1aP59672 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Anks1aP59672 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Anks1aP59672 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Anks1aP59672 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Anks1aP59672 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Anks1aP59672 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Anks1aP59672 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Anks1aP59672 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Anks1aP59672 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Anks1aP59672 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Anks1aP59672 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Anks1aP59672 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Anks1aP59672 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Anks1aP59672 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Anks1aP59672 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Anks1aP59672 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Anks1aP59672 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Anks1aP59672 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Anks1aP59672 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Anks1aP59672 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Anks1aP59672 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Anks1aP59672 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Anks1aP59672 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Anks1aP59672 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Anks1aP59672 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Anks1aP59672 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Anks1aP59672 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Anks1aP59672 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Anks1aP59672 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Anks1aP59672 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Anks1aP59672 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Anks1aP59672 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Anks1aP59672 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Anks1aP59672 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Anks1aP59672 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Anks1aP59672 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Anks1aP59672 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Anks1aP59672 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Anks1aP59672 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Anks1aP59672 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Anks1aP59672 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Anks1aP59672 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Anks1aP59672 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Anks1aP59672 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Anks1aP59672 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Anks1aP59672 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Anks1aP59672 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Anks1aP59672 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Anks1aP59672 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Anks1aP59672 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Anks1aP59672 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Anks1aP59672 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Anks1aP59672 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Anks1aP59672 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Anks1aP59672 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Anks1aP59672 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Anks1aP59672 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Anks1aP59672 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Anks1aP59672 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Anks1aP59672 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Anks1aP59672 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Anks1aP59672 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Anks1aP59672 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Anks1aP59672 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Anks1aP59672 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Anks1aP59672 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Anks1aP59672 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Anks1aP59672 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Anks1aP59672 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Anks1aP59672 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Anks1aP59672 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Anks1aP59672 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Anks1aP59672 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Anks1aP59672 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Anks1aP59672 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Anks1aP59672 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Anks1aP59672 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Anks1aP59672 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Anks1aP59672 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Anks1aP59672 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Anks1aP59672 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Anks1aP59672 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Anks1aP59672 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Anks1aP59672 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Anks1aP59672 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Anks1aP59672 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Anks1aP59672 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Anks1aP59672 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Anks1aP59672 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Anks1aP59672 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Anks1aP59672 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Anks1aP59672 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Anks1aP59672 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Anks1aP59672 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Anks1aP59672 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Anks1aP59672 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Anks1aP59672 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Anks1aP59672 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Anks1aP59672 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Anks1aP59672 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms