Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NcstnP57716 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
NcstnP57716 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NcstnP57716 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NcstnP57716 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NcstnP57716 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NcstnP57716 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
NcstnP57716 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NcstnP57716 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NcstnP57716 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NcstnP57716 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NcstnP57716 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NcstnP57716 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NcstnP57716 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NcstnP57716 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NcstnP57716 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NcstnP57716 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NcstnP57716 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NcstnP57716 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NcstnP57716 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NcstnP57716 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NcstnP57716 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NcstnP57716 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NcstnP57716 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
NcstnP57716 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NcstnP57716 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NcstnP57716 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NcstnP57716 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NcstnP57716 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NcstnP57716 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NcstnP57716 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
NcstnP57716 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NcstnP57716 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NcstnP57716 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NcstnP57716 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NcstnP57716 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NcstnP57716 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NcstnP57716 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NcstnP57716 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NcstnP57716 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NcstnP57716 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NcstnP57716 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NcstnP57716 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NcstnP57716 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NcstnP57716 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NcstnP57716 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NcstnP57716 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NcstnP57716 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NcstnP57716 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NcstnP57716 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NcstnP57716 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NcstnP57716 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NcstnP57716 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NcstnP57716 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NcstnP57716 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NcstnP57716 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NcstnP57716 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NcstnP57716 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NcstnP57716 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NcstnP57716 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NcstnP57716 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NcstnP57716 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NcstnP57716 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NcstnP57716 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NcstnP57716 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NcstnP57716 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NcstnP57716 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NcstnP57716 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NcstnP57716 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NcstnP57716 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NcstnP57716 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NcstnP57716 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NcstnP57716 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NcstnP57716 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NcstnP57716 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NcstnP57716 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NcstnP57716 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NcstnP57716 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NcstnP57716 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NcstnP57716 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NcstnP57716 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NcstnP57716 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NcstnP57716 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NcstnP57716 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NcstnP57716 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NcstnP57716 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NcstnP57716 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NcstnP57716 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NcstnP57716 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NcstnP57716 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NcstnP57716 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NcstnP57716 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NcstnP57716 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NcstnP57716 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NcstnP57716 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NcstnP57716 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NcstnP57716 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NcstnP57716 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NcstnP57716 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NcstnP57716 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms