Protein–RNA interactions for Protein: P56546

Ctbp2, C-terminal-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctbp2P56546 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ctbp2P56546 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ctbp2P56546 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ctbp2P56546 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ctbp2P56546 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ctbp2P56546 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ctbp2P56546 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ctbp2P56546 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ctbp2P56546 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ctbp2P56546 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ctbp2P56546 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ctbp2P56546 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ctbp2P56546 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ctbp2P56546 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ctbp2P56546 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ctbp2P56546 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ctbp2P56546 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ctbp2P56546 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ctbp2P56546 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ctbp2P56546 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ctbp2P56546 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ctbp2P56546 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ctbp2P56546 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ctbp2P56546 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ctbp2P56546 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ctbp2P56546 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ctbp2P56546 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ctbp2P56546 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ctbp2P56546 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ctbp2P56546 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ctbp2P56546 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ctbp2P56546 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ctbp2P56546 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ctbp2P56546 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ctbp2P56546 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ctbp2P56546 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ctbp2P56546 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ctbp2P56546 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ctbp2P56546 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ctbp2P56546 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ctbp2P56546 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ctbp2P56546 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ctbp2P56546 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ctbp2P56546 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ctbp2P56546 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ctbp2P56546 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ctbp2P56546 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ctbp2P56546 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ctbp2P56546 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ctbp2P56546 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ctbp2P56546 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ctbp2P56546 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ctbp2P56546 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctbp2P56546 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ctbp2P56546 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ctbp2P56546 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ctbp2P56546 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ctbp2P56546 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ctbp2P56546 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ctbp2P56546 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ctbp2P56546 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ctbp2P56546 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ctbp2P56546 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ctbp2P56546 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ctbp2P56546 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ctbp2P56546 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ctbp2P56546 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ctbp2P56546 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ctbp2P56546 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ctbp2P56546 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ctbp2P56546 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ctbp2P56546 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ctbp2P56546 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ctbp2P56546 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ctbp2P56546 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctbp2P56546 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ctbp2P56546 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ctbp2P56546 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ctbp2P56546 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ctbp2P56546 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ctbp2P56546 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ctbp2P56546 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ctbp2P56546 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ctbp2P56546 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ctbp2P56546 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ctbp2P56546 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ctbp2P56546 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ctbp2P56546 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ctbp2P56546 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ctbp2P56546 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ctbp2P56546 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ctbp2P56546 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ctbp2P56546 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ctbp2P56546 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ctbp2P56546 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ctbp2P56546 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ctbp2P56546 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ctbp2P56546 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ctbp2P56546 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ctbp2P56546 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms