Protein–RNA interactions for Protein: P55288

Cdh11, Cadherin-11, mousemouse

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh11P55288 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cdh11P55288 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cdh11P55288 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdh11P55288 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdh11P55288 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdh11P55288 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cdh11P55288 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdh11P55288 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdh11P55288 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdh11P55288 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdh11P55288 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdh11P55288 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdh11P55288 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cdh11P55288 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdh11P55288 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdh11P55288 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdh11P55288 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdh11P55288 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdh11P55288 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdh11P55288 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdh11P55288 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdh11P55288 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdh11P55288 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdh11P55288 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdh11P55288 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdh11P55288 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdh11P55288 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdh11P55288 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdh11P55288 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdh11P55288 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdh11P55288 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdh11P55288 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdh11P55288 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdh11P55288 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdh11P55288 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdh11P55288 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdh11P55288 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdh11P55288 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdh11P55288 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdh11P55288 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdh11P55288 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdh11P55288 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdh11P55288 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdh11P55288 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdh11P55288 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdh11P55288 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdh11P55288 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdh11P55288 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdh11P55288 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdh11P55288 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdh11P55288 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdh11P55288 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdh11P55288 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdh11P55288 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdh11P55288 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdh11P55288 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdh11P55288 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdh11P55288 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdh11P55288 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdh11P55288 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cdh11P55288 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdh11P55288 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdh11P55288 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdh11P55288 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdh11P55288 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdh11P55288 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdh11P55288 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdh11P55288 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdh11P55288 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdh11P55288 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdh11P55288 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdh11P55288 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdh11P55288 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cdh11P55288 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cdh11P55288 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdh11P55288 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdh11P55288 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdh11P55288 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdh11P55288 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdh11P55288 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdh11P55288 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdh11P55288 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdh11P55288 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdh11P55288 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdh11P55288 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdh11P55288 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdh11P55288 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdh11P55288 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdh11P55288 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdh11P55288 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdh11P55288 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdh11P55288 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdh11P55288 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdh11P55288 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdh11P55288 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdh11P55288 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdh11P55288 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdh11P55288 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdh11P55288 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdh11P55288 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms