Protein–RNA interactions for Protein: P55258

Rab8a, Ras-related protein Rab-8A, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab8aP55258 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rab8aP55258 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rab8aP55258 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rab8aP55258 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Rab8aP55258 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rab8aP55258 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rab8aP55258 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rab8aP55258 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rab8aP55258 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rab8aP55258 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rab8aP55258 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rab8aP55258 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Rab8aP55258 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rab8aP55258 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rab8aP55258 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rab8aP55258 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rab8aP55258 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rab8aP55258 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rab8aP55258 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rab8aP55258 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rab8aP55258 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rab8aP55258 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Rab8aP55258 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rab8aP55258 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rab8aP55258 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rab8aP55258 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rab8aP55258 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rab8aP55258 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rab8aP55258 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rab8aP55258 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rab8aP55258 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Rab8aP55258 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rab8aP55258 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rab8aP55258 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rab8aP55258 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rab8aP55258 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rab8aP55258 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rab8aP55258 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rab8aP55258 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Rab8aP55258 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rab8aP55258 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rab8aP55258 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rab8aP55258 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rab8aP55258 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rab8aP55258 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rab8aP55258 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Rab8aP55258 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rab8aP55258 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rab8aP55258 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rab8aP55258 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rab8aP55258 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab8aP55258 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rab8aP55258 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rab8aP55258 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rab8aP55258 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rab8aP55258 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rab8aP55258 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rab8aP55258 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rab8aP55258 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rab8aP55258 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rab8aP55258 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rab8aP55258 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rab8aP55258 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rab8aP55258 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rab8aP55258 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rab8aP55258 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rab8aP55258 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rab8aP55258 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rab8aP55258 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rab8aP55258 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rab8aP55258 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rab8aP55258 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rab8aP55258 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rab8aP55258 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rab8aP55258 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rab8aP55258 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rab8aP55258 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rab8aP55258 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rab8aP55258 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Rab8aP55258 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rab8aP55258 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rab8aP55258 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rab8aP55258 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rab8aP55258 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rab8aP55258 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rab8aP55258 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rab8aP55258 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rab8aP55258 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rab8aP55258 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rab8aP55258 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rab8aP55258 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rab8aP55258 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rab8aP55258 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rab8aP55258 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rab8aP55258 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rab8aP55258 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rab8aP55258 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rab8aP55258 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rab8aP55258 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Rab8aP55258 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms