Protein–RNA interactions for Protein: P53994

Rab2a, Ras-related protein Rab-2A, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab2aP53994 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rab2aP53994 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rab2aP53994 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rab2aP53994 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rab2aP53994 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Rab2aP53994 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rab2aP53994 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rab2aP53994 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rab2aP53994 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rab2aP53994 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Rab2aP53994 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rab2aP53994 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rab2aP53994 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rab2aP53994 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rab2aP53994 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rab2aP53994 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rab2aP53994 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rab2aP53994 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rab2aP53994 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rab2aP53994 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rab2aP53994 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rab2aP53994 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rab2aP53994 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rab2aP53994 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rab2aP53994 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rab2aP53994 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rab2aP53994 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rab2aP53994 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Rab2aP53994 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rab2aP53994 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rab2aP53994 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rab2aP53994 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rab2aP53994 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rab2aP53994 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rab2aP53994 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rab2aP53994 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rab2aP53994 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rab2aP53994 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rab2aP53994 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Rab2aP53994 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rab2aP53994 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rab2aP53994 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rab2aP53994 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rab2aP53994 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rab2aP53994 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rab2aP53994 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rab2aP53994 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rab2aP53994 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rab2aP53994 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Rab2aP53994 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rab2aP53994 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Rab2aP53994 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rab2aP53994 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rab2aP53994 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rab2aP53994 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rab2aP53994 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rab2aP53994 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rab2aP53994 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rab2aP53994 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rab2aP53994 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rab2aP53994 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rab2aP53994 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rab2aP53994 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rab2aP53994 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rab2aP53994 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rab2aP53994 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rab2aP53994 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rab2aP53994 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rab2aP53994 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rab2aP53994 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rab2aP53994 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rab2aP53994 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rab2aP53994 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rab2aP53994 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rab2aP53994 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rab2aP53994 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rab2aP53994 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rab2aP53994 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rab2aP53994 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rab2aP53994 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rab2aP53994 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rab2aP53994 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rab2aP53994 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rab2aP53994 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rab2aP53994 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rab2aP53994 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rab2aP53994 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rab2aP53994 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rab2aP53994 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rab2aP53994 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Rab2aP53994 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Rab2aP53994 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rab2aP53994 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rab2aP53994 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rab2aP53994 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rab2aP53994 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rab2aP53994 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rab2aP53994 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rab2aP53994 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rab2aP53994 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms